典型文献
基于整合转录组学分析丝氨酸蛋白酶抑制剂Hespintor抑制肝癌裸鼠移植瘤生长的潜在机制
文献摘要：
目的 利用转录物组测序技术探寻差异表达长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)、mRNA与Hespintor抗肿瘤潜在机制的关联性.方法 首先建立人肝癌裸鼠移植瘤模型,分组给药4周后取瘤体,分别构建Hespintor治疗组、溶剂对照组瘤组织cDNA文库并进行转录物组测序,基于RNA-seq数据筛选差异表达lncRNA、mRNA基因集,继而进行功能富集及相互作用分析,再利用网络模块划分方法寻找Hespintor作用靶点基因并构建调控网络.结果 筛选获得Hespintor治疗组高可信度的差异表达基因集lncRNA(DEGs lncRNA)2003个和mRNA(DEGs mRNA)1038个,DEGs lncRNA调控靶mRNA主要富集于PIP3激活Akt信号、p53信号通路、FOXO介导的转录和细胞周期等功能,DEGs mRNA主要富集于趋化因子信号通路、细胞外基质受体相互作用、补体和凝血级联等功能,两者关联性侧重体现在细胞行为、转录调控和细胞周期等三方面.结论 PI3K/Akt信号通路可能在Hespintor抑制肿瘤效应中发挥主导作用,诱导细胞周期阻滞于G1/S期并引起细胞凋亡.
文献关键词：
Hespintor;晚期肝细胞癌;转录物组测序技术;长链非编码RNA;差异表达基因集
中图分类号：
作者姓名：
伦永志;孙杰;魏玲;刘奔;董雯;潘凌鸿
作者机构：
莆田学院药学与医学技术学院医学微生态学福建省高校重点实验室,福建莆田 351100;北京市理化分析测试中心,北京 100089
文献出处：
引用格式：
[1]伦永志;孙杰;魏玲;刘奔;董雯;潘凌鸿-.基于整合转录组学分析丝氨酸蛋白酶抑制剂Hespintor抑制肝癌裸鼠移植瘤生长的潜在机制)[J].西安交通大学学报（医学版）,2022(02):202-212
A类：
Hespintor,转录物组测序,转录物组测序技术
B类：
转录组学分析,丝氨酸蛋白酶抑制剂,肝癌,裸鼠移植瘤,潜在机制,长链非编码,Long,coding,lncRNA,立人,移植瘤模型,瘤体,cDNA,文库,seq,数据筛选,功能富集,相互作用分析,利用网络,模块划分,划分方法,作用靶点,靶点基因,调控网络,可信度,差异表达基因集,DEGs,PIP3,Akt,p53,FOXO,趋化因子,细胞外基质,补体,细胞行为,转录调控,PI3K,细胞周期阻滞,G1,晚期肝细胞癌
AB值：
0.254984
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