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基于DnaSP软件分析嗜尸性丽蝇COⅠ基因序列多态性
文献摘要：
目的 基于DnaSP软件分析嗜尸性丽蝇线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(Cytochrome c Oxidase SubunitⅠ,COⅠ)基因序列,以期发现潜在的小片段多态性区域,为嗜尸性蝇类尤其是降解蝇类样本的检测以及相关技术的应用提供基础数据.方法 通过NCBI数据库检索世界范围内的嗜尸性丽蝇COⅠ序列,以丽蝇科蝇类的拉丁学名和COⅠ为关键词进行索引,序列长度大于1300 bp为限定条件.利用MEGA7.0软件比对并进行聚类,DnaSP 5.10软件分析序列多态性.结果 获得18种常见丽蝇的224条COⅠ序列,比对剪切后终序列长度为1206 bp,存在411个可变位点,滑动窗口分析结果显示,6处可变位点数目较多,分别位于185～269 bp、290～374 bp、570～689 bp、815～934 bp、955～1039 bp、1060～1179 bp.结论 长度为1206 bp的COⅠ序列中,发现6处多态性信息丰富的小片段,这为降解蝇类样本的检测以及短片段检测技术用于嗜尸性蝇类种属鉴定提供了基础资料.
文献关键词：
法医昆虫学;遗传多态性;DnaSP;嗜尸性丽蝇;COⅠ
中图分类号：
作者姓名：
翟仙敦;张卫萍;杨梦姿;阿地来 ·吐尔逊;毛孟芬;李金岭;莫耀南
作者机构：
河南科技大学法医学院,河南洛阳 471023;河南省直第三人民医院司法鉴定中心,河南郑州 450000
文献出处：
引用格式：
[1]翟仙敦;张卫萍;杨梦姿;阿地来 ·吐尔逊;毛孟芬;李金岭;莫耀南-.基于DnaSP软件分析嗜尸性丽蝇COⅠ基因序列多态性)[J].中国法医学杂志,2022(05):452-455,460
A类：
嗜尸性丽蝇
B类：
DnaSP,基因序列,体细胞,细胞色素,亚基,Cytochrome,Oxidase,Subunit,小片,蝇类,NCBI,数据库检索,丽蝇科,拉丁,学名,索引,bp,限定条件,MEGA7,软件比对,变位,滑动窗口,短片,种属鉴定,基础资料,法医昆虫学,遗传多态性
AB值：
0.298747
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