典型文献
富营养饮食重塑代谢性疾病易感猪关键组织mRNA剪接模式研究
文献摘要：
旨在探讨富营养饮食对代谢性疾病易感猪关键组织可变剪接(alternative splicing,AS)和剪接因子(spli-cing factors,SFs)的影响.本研究以健康状态、月龄和体重相同的12头代谢性疾病易感公猪为材料,随机将其分为两组,其中8头猪饲喂高脂高能量饲料2个月作为富营养饮食组(TG-HFHSD),4头猪饲喂正常饲料2个月作为对照饮食组(TG-CD).对TG-HFHSD和TG-CD的脂肪、肝、肌肉和下丘脑组织进行RNA-seq测序,利用rMATS软件鉴定组间差异AS,对差异剪接基因(differential splicing genes,DSGs)进行GO和KEGG富集分析,并利用DESeq2软件和皮尔逊相关性系数分析肝组织中的SFs.结果显示,脂肪、肝、肌肉和下丘脑中分别鉴定到48 279、39 536、47 888和52 210个AS事件,均以SE类型为主,占比在77.09％～78.29％之间.脂肪、肝、肌肉和下丘脑中的DSGs数分别为528、1 070、570和600个,其中肝增加的DSGs部分主要是RI和MXE两种类型,分别为177和471个,而其它组织仅为12～28个和99～110个.GO和KEGG富集显示,肝DSGs除富集到细胞结构相关的过程外,还显著富集到可变剪接及mRNA代谢、脂质代谢、DNA损伤及修复、补体与凝血级联等过程.肝中筛选到56个差异表达的SFs,其中CLK1、PGC-la、USP4等与糖脂代谢和代谢性疾病密切相关.本研究表明,富营养饮食显著增加了肝DSGs,通过剪接调控、糖脂代谢以及DNA损伤来影响肝代谢性疾病的发生,将为肝代谢性疾病早期发生机制研究提供参考.
文献关键词：
富营养饮食;代谢性脂肪肝病;代谢性疾病易感猪;可变剪接;剪接因子
中图分类号：
作者姓名：
夏博策;张凯艺;苗佳坤;彭焕祺;杨宇;陶聪;吴添文;王彦芳;杨述林
作者机构：
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室,北京100193
文献出处：
引用格式：
[1]夏博策;张凯艺;苗佳坤;彭焕祺;杨宇;陶聪;吴添文;王彦芳;杨述林-.富营养饮食重塑代谢性疾病易感猪关键组织mRNA剪接模式研究)[J].畜牧兽医学报,2022(08):2537-2547
A类：
富营养饮食,代谢性疾病易感猪,spli,HFHSD,rMATS,DSGs,MXE,代谢性脂肪肝病
B类：
可变剪接,alternative,splicing,AS,剪接因子,factors,SFs,健康状态,月龄,公猪,饲喂,高脂,高能量,能量饲料,CD,下丘脑,脑组织,seq,软件鉴定,鉴定组,differential,genes,富集分析,DESeq2,皮尔逊相关性系数,系数分析,肝组织,SE,RI,细胞结构,脂质代谢,伤及,补体,差异表达,CLK1,PGC,la,USP4,糖脂代谢,发生机制
AB值：
0.218831
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