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典型文献
T10脊髓节段损伤后神经源性膀胱中逼尿肌蛋白组学的生物信息分析
文献摘要:
目的:利用生物信息分析筛查舐上脊髓损伤后神经源性膀胱中逼尿肌的差异表达蛋白(differentially expressed pro-teins,DEPs)和关键信号通路.方法:采用Hassan Shaker脊髓横断法制作骶上脊髓损伤模型,利用TMT定量标记技术检测逼尿肌中表达的蛋白质,将差异倍数(fold change,FC)>1.2或<1/1.2,P<0.05,独立肽段(unique peptide)≥2的蛋白质定义为DEPs,使用Metascape对DEPs进行KEGG通路富集分析.利用STRING及Cytoscape软件构建PPI网络,使用CytoHubba插件结合蛋白质的degree值筛选前10位的DEPs.结果:模型组较空白组大鼠漏尿点压力、膀胱最大容量和逼尿肌收缩频率明显升高(P<0.01);HE染色显示模型组逼尿肌移行上皮增厚,肌纤维排列层次欠清晰.在逼尿肌中总共筛选出了244个DEPs,其中上调128个,下调116个;KEGG中显著富集了磷酸戊糖途径、肌动蛋白细胞骨架调节和多巴胺能突触等15条信号通路;通过CytoHubba筛选出前 10位的DEPs:6-磷酸葡萄糖脱氢酶(glucose dehydrogenase 6-phosphate,G6pd)、突触素(synaptophysin,Syp)、微管相关蛋白(microtubule-associated protein,Mapt)等.结论:糖代谢、细胞骨架信号系统、多巴胺能突触等方面可成为骶上脊髓损伤后逼尿肌无抑制性收缩的潜在干预靶点.
文献关键词:
骶上脊髓损伤;神经源性膀胱;蛋白组学;生物信息分析;差异表达蛋白;逼尿肌
作者姓名:
唐丽亚;瞿启睿;刘琼;张雨辰;吴霞;胡碧浓;龙轶映;许明;张泓;艾坤
作者机构:
湖南中医药大学,湖南省长沙市,410208
引用格式:
[1]唐丽亚;瞿启睿;刘琼;张雨辰;吴霞;胡碧浓;龙轶映;许明;张泓;艾坤-.T10脊髓节段损伤后神经源性膀胱中逼尿肌蛋白组学的生物信息分析)[J].中国康复医学杂志,2022(07):865-871
A类:
G6pd,Syp,Mapt
B类:
T10,节段,逼尿肌,肌蛋白,蛋白组学,生物信息分析,利用生物,脊髓损伤后神经源性膀胱,差异表达蛋白,differentially,expressed,teins,DEPs,Hassan,Shaker,骶上脊髓损伤,损伤模型,TMT,标记技术,倍数,fold,change,FC,unique,peptide,Metascape,通路富集分析,STRING,Cytoscape,软件构建,PPI,CytoHubba,插件,结合蛋白,degree,漏尿点压力,膀胱最大容量,肌收缩,HE,移行上皮,皮增厚,肌纤维,总共,磷酸戊糖途径,肌动蛋白,细胞骨架,多巴胺能突触,酸葡萄,葡萄糖脱氢酶,glucose,dehydrogenase,phosphate,突触素,synaptophysin,微管,microtubule,associated,protein,糖代谢,信号系统,抑制性,干预靶点
AB值:
0.390854
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