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典型文献
颈动脉粥样硬化差异基因筛选及小檗碱干预颈动脉粥样硬化机制的生物信息学研究
文献摘要:
目的 以生物信息学方法探讨颈动脉粥样硬化发病新的潜在机制,挖掘小檗碱干预颈动脉粥样硬化的潜在靶点和途径.方法 检索获取美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库并获取颈动脉粥样硬化斑块基因表达芯片GSE28829数据集,筛选样本差异表达基因数据并进行富集分析;检索获取小檗碱的潜在作用靶点,与颈动脉粥样硬化差异表达基因取交集,获得小檗碱干预颈动脉粥样硬化的潜在靶点,进行富集分析并筛选核心靶点.结果 共筛选获得颈动脉粥样硬化差异表达基因174个,涉及趋化因子、核因子κB、Toll样受体、脂肪酸降解等信号通路.筛选获得小檗碱干预颈动脉粥样硬化的潜在靶点5个,涉及流体剪切力与动脉硬化、白细胞介素17、肿瘤坏死因子等信号通路,经拓扑及富集分析,CCL2、HMOX1和MMP-9可能是小檗碱干预颈动脉粥样硬化的核心靶点.结论 颈动脉粥样硬化差异表达基因主要富集于炎性反应、脂质代谢等信号通路;小檗碱可能通过介导CCL2、HMOX1、MMP-9等靶点调控流体剪切力、白细胞介素17、肿瘤坏死因子等信号通路而干预颈动脉粥样硬化.
文献关键词:
颈动脉粥样硬化;小檗碱;信号通路;生物信息学
作者姓名:
张金霞;王玉涛;孙岩
作者机构:
滨州市第二人民医院药学部,山东省滨州市256600;济南市中医医院周围血管病科,山东省济南市250012;山东第一医科大学附属省立医院血管外科,山东省济南市250021
引用格式:
[1]张金霞;王玉涛;孙岩-.颈动脉粥样硬化差异基因筛选及小檗碱干预颈动脉粥样硬化机制的生物信息学研究)[J].中国动脉硬化杂志,2022(02):117-124
A类:
B类:
差异基因筛选,小檗碱,生物信息学研究,生物信息学方法,潜在机制,潜在靶点,生物技术,信息中心,中心基因,基因表达综合数据库,颈动脉粥样硬化斑块,GSE28829,选样,差异表达基因,基因数据,富集分析,潜在作用,作用靶点,交集,核心靶点,趋化因子,核因子,Toll,样受体,流体剪切力,动脉硬化,CCL2,HMOX1,MMP,炎性反应,脂质代谢,控流
AB值:
0.175699
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