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典型文献
药食同源植物薤白的谱系地理学研究
文献摘要:
对我国14个地区的药食同源植物薤白(Allium macrostemon)的叶绿体基因片段(psbA-trnH、rps16和trnL-F)与核基因片段(ITS)进行测序分析,揭示薤白的遗传变异分布式样、单倍型地理分布格局,并推断其在第四纪冰期的避难所.结果表明:薤白叶绿体基因(cpDNA)遗传多样性低于核基因(nrDNA)遗传多样性(cpDNA:HT=0.868;nrDNA:HT=0.890).cpDNA和nrDNA的分子变异分析(AMOVA)结果显示:薤白遗传变异主要发生在居群间(cpDNA:92.84%;nrDNA:98.40%),存在遗传分化(cpDNA:Nst=0.918,Gst=0.866,Fst=0.928;nrDNA:Nst=0.984,Gst=0.855,Fst=0.984),且Nst均大于Gst,表明该物种具有明显的谱系地理结构.在薤白居群中,共检测到11个叶绿体单倍型和14个nrDNA基因型;单倍型网络图及地理分布图表明,叶绿体单倍型H3、核DNA基因型H1频率最高,位于网络结构图的中心位置,可能为古老单倍型.此外,冰期避难所假说认为遗传多样性高、拥有古老单倍型和较多特有单倍型的区域可能是该物种的冰期避难所,因此推测薤白在第四纪冰期时可能在大盘山、天水和通化地区存在多个冰期避难所.这些分析可为类似草本植物的进化提供参考,丰富对东亚草本植物分子系统与生物地理学的认识.
文献关键词:
薤白;居群;谱系地理学;遗传变异;避难所
作者姓名:
石甜;莫忠妹;吴敏;赵财
作者机构:
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院,山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室,山地生态与农业生物工程协同创新中心,贵阳 550025
文献出处:
引用格式:
[1]石甜;莫忠妹;吴敏;赵财-.药食同源植物薤白的谱系地理学研究)[J].植物研究,2022(04):574-583
A类:
macrostemon,Nst
B类:
药食同源植物,薤白,谱系地理学,Allium,叶绿体基因,psbA,trnH,rps16,trnL,ITS,测序分析,遗传变异,式样,单倍型,地理分布格局,第四纪冰期,避难所,cpDNA,遗传多样性,nrDNA,HT,变异分析,AMOVA,居群,遗传分化,Gst,Fst,基因型,网络图,分布图,图表,H3,H1,网络结构图,中心位置,假说,多特,大盘,盘山,天水,通化,草本植物,东亚,生物地理学
AB值:
0.286263
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