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典型文献
基于宏基因组测序技术对绵羊呼吸道微生物群落的研究
文献摘要:
试验采用宏基因组测序技术对4例呼吸道症状发病绵羊(试验组)和4例健康绵羊(对照组)的鼻拭子样本进行高通量测序,分析不同样品间微生物菌群结构功能差异.结果发现,试验组物种注释上,厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门占主导地位;功能注释上,信号传导、氨基酸代谢所含基因数量最多;抗性基因注释上,葡萄球菌和埃希氏杆菌属耐药基因分布最广存在于8个样品中,耐药基因novA、antibiotic、msbA、Mycobacterium、macB广泛存在于除了样品D1以外的其他样品中.发病绵羊呼吸道微生物菌群结构较为复杂,呼吸道菌群结构变化对绵羊机体发病影响显著.
文献关键词:
绵羊;宏基因组;病原微生物;高通量测序;群落结构
作者姓名:
刘海霞;韩大勇;闫伟;朱爱文;周明夏;王步忠;吴昊;耿昕之
作者机构:
江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300;江苏西来原生态农业有限公司,江苏泰州 225328;江苏省阜宁县农业农村局,江苏盐城 224400
文献出处:
引用格式:
[1]刘海霞;韩大勇;闫伟;朱爱文;周明夏;王步忠;吴昊;耿昕之-.基于宏基因组测序技术对绵羊呼吸道微生物群落的研究)[J].中国饲料,2022(18):31-34
A类:
novA,msbA,macB
B类:
宏基因组测序技术,绵羊,呼吸道微生物群,微生物群落,呼吸道症状,鼻拭子,子样本,微生物菌群结构,结构功能,功能差异,厚壁菌门,变形菌门,拟杆菌门,放线菌,功能注释,信号传导,氨基酸代谢,所含,抗性基因,基因注释,埃希氏,氏杆菌,杆菌属,耐药基因,基因分布,antibiotic,Mycobacterium,D1,呼吸道菌群结构,病原微生物,群落结构
AB值:
0.284952
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