典型文献
宏基因组测序分析奶牛运动场土壤抗生素抗性基因
文献摘要:
[目的]探究规模化奶牛场运动场内粪尿污染的土壤中抗生素抗性基因情况.[方法]采集北京地区某规模化奶牛运动场中心至外围3个不同半径位置的土壤进行宏基因组测序,在微生物组成研究基础上进行抗性基因(ARGs)功能注释.[结果]土壤中抗性基因检出率最高的是rpoB2和rpoB,注释为利福霉素抗性基因,耐药菌分别为诺卡氏菌属和双歧杆菌属.其次是MexF和MexW,注释为苯丙醇类、二氨基嘧啶、氟喹诺酮、四环素类、吖啶染料、大环内酯类抗生素,显示了多重耐药风险较高,耐药菌株主要为铜绿假单胞菌.此外还发现从运动场中心至外围土壤中抗性基因逐渐增多,可能是由于土壤内粪尿逐渐扩散富集作用造成的.[结论]通过分析发现该奶牛场土壤中利福霉素、苯丙醇类、氟喹诺酮类、四环素类、大环内酯类、氨基糖苷类抗生素耐药基因数量多.
文献关键词:
宏基因组测序;奶牛场;土壤;抗性基因
中图分类号:
作者姓名:
胡平;关文怡;雷莉辉;蔡泽川
作者机构:
北京农业职业学院,北京102442
文献出处:
引用格式:
[1]胡平;关文怡;雷莉辉;蔡泽川-.宏基因组测序分析奶牛运动场土壤抗生素抗性基因)[J].养殖与饲料,2022(08):5-11
A类:
奶牛运动场,rpoB2,MexF,MexW
B类:
宏基因组测序,测序分析,抗生素抗性基因,规模化奶牛场,场内,北京地区,微生物组成,ARGs,功能注释,利福霉素,诺卡氏菌,双歧杆菌属,苯丙,丙醇,醇类,嘧啶,四环素类,吖啶,染料,大环内酯类抗生素,多重耐药,耐药菌株,铜绿假单胞菌,富集作用,氟喹诺酮类,氨基糖苷类抗生素,抗生素耐药基因
AB值:
0.19686
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