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典型文献
甘油-3-磷酸脱氢酶1-样酶通过调节细胞凋亡对肾透明细胞癌的影响
文献摘要:
目的:探讨甘油-3-磷酸脱氢酶1-样酶(GPD1L)对肾透明细胞癌的影响及其机制。方法:选择来自肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)的两个主要的微阵列数据库(GSE16441、GSE36895、GSE53757、GSE66270、GSE68417),探讨在肾透明细胞癌(ccRCC)肿瘤样本中低表达基因,并进行生存分析。选择与患者生存差异最显著的基因GPD1L进行体外验证。体外培养正常人肾小管上皮细胞HK-2及ACHN、786-O、769-P 3种人肾细胞癌细胞株,利用聚合酶链反应(PCR)和Western blot验证GPD1L在肾癌细胞株中的表达量。利用GSE16441微阵列数据进行GPD1L的单基因富集分析,观察GPD1L参与调控的相关通路。随后利用pcDNA3.1过表达质粒,过表达ACHN、769-P肾癌细胞中GPD1L的表达,利用划痕、原位缺口末端标记法(TUNEL)、流式细胞术和Western blot探讨GPD1L对肾癌细胞迁移、凋亡的影响。多组间比较采用单因素方差分析,两两比较采用LSD- t检验。 结果:对5个ccRCC微阵列数据集的综合分析确定了ccRCC中SLC4A1、GPD1L、CLCNKB 3个显著的低表达基因,并且这3个基因的表达量均与患者的生存时间呈正相关( P<0.05)。PCR和Western blot结果表明,在ACHN、786-O、769-P 3种细胞株中,GPD1L mRNA和蛋白的表达水平显著低于HK-2细胞(转录表达值:0.163±0.067比1.000±0.124, t=7.838, P<0.01;0.338±0.171比1.000±0.124, t=6.982, P<0.01;0.626±0.147比1.000±0.124, t=5.632, P<0.05)。Western blot结果显示,在ACHN、769-P肾癌细胞中,pcDNA-GPD1L组GPD1L蛋白的表达量明显高于pcDNA-Vector组(条带相对灰度值:2.343±0.371比1.000±0.122, t=5.776, P<0.01;3.207±0.537比1.000±0.082, t=6.224, P<0.01);肾癌样本中GPD1L单基因GSEA富集分析显示凋亡相关通路被明显抑制。同时,pcDNA-GPD1L组细胞凋亡率明显高于pcDNA-Vector组[流式:(30.14±1.05)%比(5.20±1.21)%, t=7.775, P<0.01;(28.54±2.13)%比(3.44±1.34)%, t=6.862, P<0.01],划痕结果也显示pcDNA-GPD1L组细胞增殖能力明显低于pcDNA-Vector组。 结论:过表达GPD1L能够通过激活肾透明细胞癌内的细胞凋亡,而抑制肾透明细胞癌的发展。
文献关键词:
甘油-3-磷酸脱氢酶1样酶;肾透明细胞癌;凋亡
作者姓名:
刘廷;祝恒成;杨康;程帆
作者机构:
武汉大学人民医院泌尿外科 443002
引用格式:
[1]刘廷;祝恒成;杨康;程帆-.甘油-3-磷酸脱氢酶1-样酶通过调节细胞凋亡对肾透明细胞癌的影响)[J].中华实验外科杂志,2022(08):1590-1594
A类:
GPD1L,GSE16441,GSE36895,GSE66270,GSE68417
B类:
肾透明细胞癌,肿瘤基因组图谱,TCGA,GEO,微阵列数据,GSE53757,ccRCC,低表达,表达基因,生存分析,生存差异,体外培养,养正,正常人,人肾小管上皮细胞,HK,ACHN,肾细胞癌,细胞株,聚合酶链反应,blot,肾癌细胞,单基因,基因富集分析,相关通路,pcDNA3,过表达质粒,划痕,末端标记,标记法,TUNEL,流式细胞术,癌细胞迁移,单因素方差分析,LSD,SLC4A1,CLCNKB,生存时间,转录表达,Vector,条带,相对灰度值,GSEA,细胞凋亡率,细胞增殖能力
AB值:
0.205607
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