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典型文献
重度特应性皮炎患者急性期和缓解期皮肤微生态研究
文献摘要:
目的:探索重度特应性皮炎(AD)成人患者急性期及缓解期皮肤微生态结构和功能的变化特点。方法:采集2019年10月至2020年11月于广州市皮肤病防治所门诊就诊的4例成人重度AD患者急性期和缓解期5个部位(面颊、肘窝、手背、腹部、下肢)皮屑标本,利用第二代高通量测序技术进行宏基因组测序,构建皮肤微生物样本基因集,获得各个样本的物种注释信息并进行生物信息学数据分析。结果:4例重度AD患者皮肤中,共检测到18个门,37个纲,73个目,142个科,237个属,331个种。与急性期相比,缓解期AD患者皮肤微生物群落多样性上升,皮肤微生物的相对丰度发生变化( P < 0.05)。在微生物种水平上,金黄色葡萄球菌对AD急性期的影响程度最高,表皮葡萄球菌、奥斯陆莫拉菌、弗朗西丝菌、科氏葡萄球菌、沃氏葡萄球菌、球形马拉色菌以及限制性马拉色菌在AD缓解期富集(|lg线性判别分析值| > 2,Kruksal-Wallis检验,均 P < 0.05)。对微生物丰度差异基因行KEGG功能通路分析,共注释富集于355个功能通路,其中显著富集的通路38个(均 P < 0.05),主要涉及金黄色葡萄球菌感染、色氨酸代谢、组氨酸代谢、氮代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成与降解、脂肪酸降解及过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路等。 结论:重度AD患者急性期和缓解期皮肤微生态结构存在显著差异,预测其可能与多个功能通路(如金黄色葡萄球菌感染、色氨酸代谢、组氨酸代谢、氮代谢等)水平相关。
文献关键词:
皮炎,特应性;微生物群落;皮肤;宏基因组学;代谢网络和途径
作者姓名:
何素玲;田歆;梁景耀;邵蕾;李俊龙;黄琼霄;刘玉梅;王建琴
作者机构:
广州医科大学皮肤病研究所 广州市皮肤病防治所皮肤科,广州 510095;何素玲现在广州市荔湾中心医院皮肤科,广州 510145
文献出处:
引用格式:
[1]何素玲;田歆;梁景耀;邵蕾;李俊龙;黄琼霄;刘玉梅;王建琴-.重度特应性皮炎患者急性期和缓解期皮肤微生态研究)[J].中华皮肤科杂志,2022(04):329-336
A类:
Kruksal,代谢网络和途径
B类:
特应性皮炎,急性期,和缓,缓解期,皮肤微生态,AD,成人患者,生态结构,结构和功能,变化特点,皮肤病,防治所,门诊就诊,面颊,肘窝,手背,皮屑,第二代高通量测序,高通量测序技术,宏基因组测序,微生物样本,皮肤微生物群,微生物群落多样性,相对丰度,表皮葡萄球菌,奥斯陆,莫拉,弗朗西,沃氏葡萄球菌,球形马拉色菌,限制性,lg,线性判别分析,Wallis,微生物丰度,差异基因,通路分析,金黄色葡萄球菌感染,色氨酸代谢,组氨酸代谢,氮代谢,精氨酸,脯氨酸代谢,缬氨酸,异亮氨酸,生物合成,过氧化物酶体增殖物激活受体,宏基因组学
AB值:
0.255821
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