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典型文献
厚壳贻贝不同组织中的微生物群落结构
文献摘要:
为了解厚壳贻贝各组织中微生物的分布差异,本实验在Illumina MiSeq测序平台利用16S rDNA克隆子测序(V3~V4区)对嵊泗养殖贻贝的血淋巴、消化腺、肾脏、鳃、外套膜、性腺和足等7种组织中的微生物群落结构进行分析,并比较组织间微生物的多样性差异.结果显示,21个样本平均产生36860条高质量序列.血淋巴共有1237个操作分类单元(OTU),其次是消化腺(1014个OTU)和肾脏(1015个OTU),性腺最少(仅有553个OTU).尽管血淋巴OTU数最高,但仅有9个独有OTU.肾脏拥有最多172个独有OTU,消化腺次之(144个独有OTU).所有组织中均以变形菌门、拟杆菌门和疣微菌门为主要菌群.通过Bray-Curtis相似矩阵,血淋巴、消化腺、肾脏和足的细菌聚成一支,而鳃、性腺和外套膜的细菌群落更为相似.Alpha多样性指数分析显示,血淋巴、消化腺和肾脏微生物多样性最高.研究表明,厚壳贻贝微生物存在一定的组织差异性,这将为今后深入阐释厚壳贻贝与微生物之间的相互作用及其调控机理奠定基础.
文献关键词:
厚壳贻贝;微生物群落;组织差异分布;16S rDNA
作者姓名:
何治江;贾梦雪;王锦乙;严小军;廖智;何建瑜
作者机构:
浙江海洋大学海洋科学与技术学院,海洋生物蛋白质工程研究室,浙江舟山 316022
文献出处:
引用格式:
[1]何治江;贾梦雪;王锦乙;严小军;廖智;何建瑜-.厚壳贻贝不同组织中的微生物群落结构)[J].水产学报,2022(12):2421-2431
A类:
组织差异分布
B类:
厚壳贻贝,不同组织,微生物群落结构,分布差异,Illumina,MiSeq,测序平台,16S,rDNA,隆子,V3,V4,嵊泗,血淋巴,消化腺,外套膜,性腺,操作分类单元,OTU,有组织,变形菌门,拟杆菌门,Bray,Curtis,相似矩阵,细菌群落,Alpha,多样性指数,指数分析,微生物多样性,组织差异性,调控机理
AB值:
0.270793
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