典型文献
火龙果己糖转运蛋白基因克隆及生物信息学分析
文献摘要:
[目的]己糖转运蛋白(Hexose Transporter,HXT)是一种单糖转运蛋白,能够跨膜转运甘露糖、果糖和葡萄糖等己糖类物质,参与花粉发育和植株生长,进而决定果实的内在品质.分析火龙果HXT基因生物信息学及表达特性,可为调节火龙果果实品质奠定基础.[方法]通过基因克隆得到1个火龙果已糖转运蛋白基因,应用NCBI、BioEdit和DNAMAN等软件或数据库对其进行生物信息学分析,并利用HLPC技术分析成熟期果实中的可溶性糖含量,采用荧光定量PCR等方法分析不同株系火龙果及果实中不同部位的HTX基因的表达特性.[结果]通过PCR扩增从火龙果中克隆得到1个HXT基因,命名为HuHXT.该基因序列全长1 230 bp,编码410个氨基酸.蛋白不稳定系数35.59,有32个Ser、15个Thr和15个Tyr.火龙果中可溶性糖组分主要为蔗糖、葡萄糖和果糖,以葡萄糖和果糖为主.HuHXT在97号株系中表达量最高,其次为湛红2号(ZH)和128号株系,15号和16号株系表达量较少;HuHXT的表达量在同一果实不同部位差别不显著,在靠近果皮部位表达量较高.[结论]HuHXT为Sugar-tr基因家族成员,该蛋白属于稳定蛋白,疏水性较强,是一种膜蛋白,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.HuHXT表达量与果实中葡萄糖含量呈负相关关系,即HuHXT表达量越高、葡萄糖含量越少.
文献关键词:
火龙果;己糖转运蛋白;生物信息学;葡萄糖;基因表达
中图分类号:
作者姓名:
李甜子;郑雪文;曹新玥;陈嘉华;杨转英
作者机构:
广东海洋大学滨海农业学院,广东湛江524088
文献出处:
引用格式:
[1]李甜子;郑雪文;曹新玥;陈嘉华;杨转英-.火龙果己糖转运蛋白基因克隆及生物信息学分析)[J].广东农业科学,2022(03):31-39
A类:
Hexose,HXT,HLPC,HTX,HuHXT
B类:
火龙果,己糖转运蛋白,糖转运蛋白基因,基因克隆,生物信息学分析,Transporter,单糖转运蛋白,跨膜转运,甘露糖,果糖,糖类物质,花粉发育,植株生长,内在品质,表达特性,果实品质,NCBI,BioEdit,DNAMAN,成熟期,可溶性糖含量,株系,不同部位,基因序列,全长,bp,不稳定系数,Ser,Thr,Tyr,可溶性糖组分,蔗糖,ZH,位差,果皮,皮部,Sugar,tr,基因家族,疏水性,膜蛋白,二级结构,无规则,卷曲,中葡,越少
AB值:
0.282501
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