典型文献
基于癌症多组学数据库深度解析磷酸甘油激酶1在肝细胞癌中的表达及临床意义
文献摘要：
目的 探讨磷酸甘油激酶1(PGK1)在肝细胞癌(HCC)发生中的作用以及其潜在的蛋白质翻译后修饰位点,为PGK1作为肝癌诊断生物标志物和防控靶点提供依据.方法 以泛癌的角度,从癌症基因组数据库TCGA中获取10 967份样本资料,利用cBioPortal和UALCAN肿瘤基因分析工具,探讨PGK1基因在不同肿瘤中的表达情况和预后改变,随后将目标聚焦在肝细胞癌中,分析PGK1在肝肿瘤组织和正常组织间的表达差异;从GEO数据库获取肝癌患者的样本数据,分析PGK1在诱发肝细胞癌发生发展中的潜在作用;同时,通过Real-time PCR、Western blotting实验等从mRNA、蛋白水平分析PGK1在肝细胞癌和癌旁组织中的表达差异,并进行细胞侵袭、增殖实验的功能验证;通过String数据库检索PGK1相关蛋白并进行功能富集分析;最后采用CSS-Palm数据库和生物信息学方法预测PGK1上的蛋白质翻译后修饰位点.结果 PGK1基因在包括肝细胞癌在内的多种实体瘤中异常扩增和过度表达,且PGK1的高表达与肝细胞癌的不良预后相关.PGK1多个位点上存在多种新型表观遗传修饰位点.结论 PGK1与包括肝癌在内的多种癌症的发生发展及糖酵解代谢异常密切相关,表观遗传修饰能够调控PGK1并影响其细胞功能.
文献关键词：
磷酸甘油激酶1;癌症;肝细胞癌;生物信息学;糖酵解;预后;免疫印迹法;人
中图分类号：
作者姓名：
管成剑;于华婧;张小东;饶全;张伟涛;刘坤;吴鸿伟;汪栋;张忠涛;郭伟
作者机构：
首都医科大学附属北京友谊医院普通外科,国家消化系统疾病临床医学研究中心,北京 100050
文献出处：
引用格式：
[1]管成剑;于华婧;张小东;饶全;张伟涛;刘坤;吴鸿伟;汪栋;张忠涛;郭伟-.基于癌症多组学数据库深度解析磷酸甘油激酶1在肝细胞癌中的表达及临床意义)[J].解剖学报,2022(06):744-753
A类：
B类：
多组学数据,深度解析,磷酸甘油,肝细胞癌,PGK1,HCC,蛋白质翻译后修饰,修饰位点,诊断生物标志物,泛癌,癌症基因组数据库,TCGA,cBioPortal,UALCAN,肿瘤基因,基因分析,肝肿瘤,肿瘤组织,正常组织,表达差异,GEO,肝癌患者,潜在作用,Real,blotting,水平分析,癌旁组织,细胞侵袭,功能验证,String,数据库检索,功能富集分析,CSS,Palm,生物信息学方法,实体瘤,过度表达,不良预后,个位,表观遗传修饰,糖酵解,代谢异常,细胞功能,免疫印迹法
AB值：
0.284206
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
