典型文献
Epsin3在结直肠癌中的差异表达及生物信息学分析
文献摘要：
目的 探讨介导内吞作用的衔接蛋白epsin 3(EPN3)在结直肠癌中的表达及意义,为深入研究EPN3的调控模式提供实验依据.方法 分别运用GEPIA和GEDS数据库分析EPN3在结直肠癌组织和细胞中的表达情况,并通过SMART和cBioPortal数据库分析EPN3基因甲基化和拷贝数变异与其表达水平的关系;利用Metascape数据库对EPN3相关的共表达基因集进行GO富集和通路分析;运用BioPlex蛋白互作数据库分析EPN3在HCT116细胞中的蛋白作用网络.为了对EPN3进一步验证,我们收集13对结直肠癌癌旁组织和癌组织标本,用Real-time PCR检测EPN3 mRNA表达;并通过敲减EPN3观察其对肿瘤细胞增殖、集落形成和迁移能力的影响.结果 GEPIA、GEDS、SMART和cBioPortal等数据库分析显示,EPN3在结直肠肿瘤组织中高表达(P＜0.01).其表达水平与甲基化和拷贝数变异相关.EPN3相关基因的富集结果显示主要与细胞黏附相关.EPN3与UBB、CCDC130、TNFAIP1、PHGDH、EPN2等构成的蛋白相对作用网络与蛋白泛素化有关.Real-time PCR结果显示,EPN3在癌组织中高表达(P＜0.05).通过沉默EPN3可以抑制HCT116和HT29细胞的增殖、集落形成和迁移能力.结论 EPN3在结直肠癌组织中高表达,且与细胞黏附和蛋白泛素化等生物学过程有关,敲低EPN3可抑制结直肠癌细胞系HCT116和HT29的增殖、集落形成和迁移等过程.
文献关键词：
结直肠癌;Epsin3;生物信息学;集落形成;划痕实验;实时定量聚合酶链反应;人
中图分类号：
作者姓名：
向丽莼;姜钟翔;姜小叶;陈雪诺;姜政
作者机构：
重庆医科大学附属第一医院消化内科,重庆 400016;重庆市人民医院呼吸内科,重庆 400013
文献出处：
引用格式：
[1]向丽莼;姜钟翔;姜小叶;陈雪诺;姜政-.Epsin3在结直肠癌中的差异表达及生物信息学分析)[J].解剖学报,2022(04):507-514
A类：
Epsin3,epsin,EPN3,BioPlex,CCDC130,TNFAIP1,EPN2
B类：
差异表达,生物信息学分析,内吞,调控模式,GEPIA,GEDS,数据库分析,结直肠癌组织,SMART,cBioPortal,基因甲基化,拷贝数变异,Metascape,共表达基因,通路分析,蛋白互作,作数,HCT116,癌旁组织,组织标本,Real,敲减,肿瘤细胞增殖,集落形成,迁移能力,结直肠肿瘤,肿瘤组织,异相,集结,细胞黏附,UBB,PHGDH,白相,蛋白泛素化,HT29,细胞的增殖,附和,生物学过程,敲低,可抑制,结直肠癌细胞,细胞系,划痕实验,实时定量聚合酶链反应
AB值：
0.226578
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