典型文献
M6A甲基化调控因子对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响
文献摘要：
目的 探讨N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)相关基因对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响.方法 从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和21个M6A相关基因的表达谱数据,R软件分析差异基因;聚类分析和主成分分析(principal component analysis,PCA)分析M6A相关基因;单因素Cox回归分析筛选预后相关M6A基因,LASSO算法建立风险预测模型;筛选结直肠癌相关差异lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),与M6A相关基因建立共表达网络.使用实时荧光定量PCR(real time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)检测 M6A reader 脆性 X 智力低下 1(fragile X mental retardation 1,FMR1)在结直肠癌组织中的表达,在结直肠癌细胞中敲除FMR1基因,通过CCK-8、划痕实验、Transwell和细胞凋亡实验检测细胞的增殖、迁移、侵袭和凋亡情况.结果 21个M6A相关基因中有15个基因在结直肠癌中差异表达.聚类分析显示,结直肠癌肿瘤分成2种亚型;从建立的风险模型得出烷基化修复同源蛋白 5(a-ketoglutarate-dependent dioxygenase alk B homolog 5,ALKBH5)、YTH 结构域蛋白 2(YTH domaincontaining protein 2,YTHDC2)和FMR1可能是独立的预后因子.随后,筛选出1 784个DElncRNA,构建包含3个预后因子和18个DElncRNAs的共表达网络.网络图中发现FMR1基因占主导地位,RT-qPCR实验发现FMR1在结直肠癌组织中上调;FMR1基因的敲除能抑制结直肠癌HT-29细胞的增殖,迁移和侵袭能力,促进结直肠癌细胞的凋亡.结论 M6A甲基化调控因子ALKBH5、YTHDC2和FMR1可能是结直肠癌中的独立预后因子,FMR1基因的敲除能抑制结直肠癌细胞的增殖、迁移、侵袭,促进结直肠癌细胞的凋亡.
文献关键词：
M6A甲基化;预后;LASSO风险模型;FMR1
中图分类号：
作者姓名：
刘宁;江帆;陈之巨;王葆春;吕云福
作者机构：
570311海口,海南省人民医院胃肠外一科
文献出处：
引用格式：
[1]刘宁;江帆;陈之巨;王葆春;吕云福-.M6A甲基化调控因子对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响)[J].陆军军医大学学报,2022(11):1126-1135
A类：
alk,domaincontaining,DElncRNAs
B类：
M6A,甲基化,调控因子,细胞生物学行为,N6,腺苷,methyladenosine,m6A,肿瘤基因组图谱,cancer,genome,atlas,TCGA,下载,长链非编码,long,noncoding,表达谱,谱数据,差异基因,principal,component,analysis,Cox,LASSO,风险预测模型,differentially,expressed,共表达网络,real,fluorescence,quantitative,qPCR,reader,脆性,智力低下,fragile,mental,retardation,FMR1,结直肠癌组织,结直肠癌细胞,敲除,CCK,划痕实验,Transwell,实验检测,细胞的增殖,差异表达,癌肿,风险模型,烷基化,同源蛋白,ketoglutarate,dependent,dioxygenase,homolog,ALKBH5,结构域,protein,YTHDC2,预后因子,网络图,HT,迁移和侵袭,侵袭能力
AB值：
0.277381
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