为探讨不同代次雄性ICR小鼠生长发育与其肠道微生物的关系,本研究通过对16SrRNA基因V3～V4区测序,分析F0到F3代雄性ICR小鼠肠道菌群多样性和菌种组成.结果显示:1)从F0到F3代,组间微生物的Alpha多样性中的Chaol指数,Observed-species指数和香侬指数(Shannon)指数随代次积累显著降低(P＜0.05),Simpson指数无显著差异(P＞0.05).2)从F0到F3代的优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)(F0、F1、F2和F3丰度分别为 83.3％、79.0％、81.8％和 90.3％)和拟杆菌门(Bacteroides)(F0、F1、F2 和 F3 丰度分别为 6.0％、5.1％、4.0％和3.2％).3)F0,F1和F2代三组的优势菌属均为乳酸菌属(Lactobacillus)(F0、F1和F2丰度分别为83.1％、62.8％和38.2％),但F3代的一些未确认分类的菌属占比较高,丰度约为45.3％;从F0到F3代在属水平上微生物组成上存在显著差异(P＜0.05),各组的乳酸菌属丰度随代次的积累显著降低(P＜0.05).4)对差异菌属进行了 KEGG差异代谢通路预测,发现乙醛酸盐代谢、胰岛素信号通路、苯丙氨酸,色氨酸和酪氨酸生物合成途径,萜类化合物生物合成途径,肽聚糖生物合成和糖酵解糖异生作用在F3代中显著降低,表明F3代氨基酸合成、糖类代谢等多条基础代谢通路受损.综上,本研究基于微生物16SrRNA测序技术对ICR小鼠传代后肠道菌群变化进行了一系列分析和功能预测,发现微生物多样性发生改变,F0至F2代优势菌门未发生明显变化,但在F3代出现了较多的为确认分类菌属,并且在属水平上各组的乳酸菌属丰度随代次的积累显著降低,F3代氨基酸合成、糖类代谢等多条基础代谢通路受到影响.本研究有助于从肠道微生物与宿主间的相互作用角度解释ICR雄性小鼠传代后出现的体重偏低等现象产生的原因.

肠道微生物;ICR雄性小鼠;16SrRNA测序;KEGG代谢通路预测

张璐瑶;孟琳;颛清芮;傅祥伟;侯云鹏

中国农业大学生物学院/农业生物技术国家重点实验室,北京100193;中国农业大学动物科技学院/畜禽育种国家工程实验室,北京100193;新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,新疆石河子832000

中国农业大学学报

[1]张璐瑶;孟琳;颛清芮;傅祥伟;侯云鹏-.基于微生物16SrRNA测序技术对ICR小鼠传代后肠道菌群变化的分析)[J].中国农业大学学报,2022(07):126-136

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