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典型文献
白纹伊蚊性别差异miRNA筛选及miRNA-mRNA调控网络分析
文献摘要:
目的 研究雌、雄白纹伊蚊中差异表达的miRNA及其相对应的mRNA靶基因,进而探讨雌、雄白纹伊蚊miRNA-mRNA间的调控关系、预测关键基因的潜在功能,为阐明白纹伊蚊性别分化的调控机制积累资料.方法 通过构建雌、雄白纹伊蚊miRNA文库和mRNA测序分析,分别得到雌、雄白纹伊蚊差异表达miRNA和mRNA信息,采用生物信息学方法预测差异表达miRNA的靶基因,将预测得到的miRNA的靶基因与雌、雄样品间差异表达mRNA进行重叠筛选,然后构建miRNA-mRNA互作关系网络图.进一步对miRNA对应的靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,了解miRNA可能的功能.结果 筛选到74个雌、雄差异表达miRNA,其中包含8个性别特异性miRNA.分别获得雌性特异表达的miRNA-mRNA470对(miRNA低表达、mRNA高表达)和雄性特异表达的miRNA-mRNA481对(miRNA高表达、mRNA低表达).通过互作网络和功能富集分析,检测到4个与雌、雄白纹伊蚊性别分化及生殖功能相关的mRNA,以及直接参与调控它们的17个miRNA.结论 构建了雌、雄白纹伊蚊样品中差异表达的miRNA-mRNA互作网络,筛选获得性别相关的17个miRNA和4个mRNA,为进一步验证miRNA在白纹伊蚊性别分化中的调控作用奠定基础.
文献关键词:
白纹伊蚊;性别分化;miRNA-mRNA;调控网络分析
作者姓名:
刘文娟;张可心;程鹏;张心雨;张倩;张忠;张瑞玲
作者机构:
山东第一医科大学基础医学院,山东泰安271016;山东第一医科大学寄生虫病防治研究所,山东济宁272033
引用格式:
[1]刘文娟;张可心;程鹏;张心雨;张倩;张忠;张瑞玲-.白纹伊蚊性别差异miRNA筛选及miRNA-mRNA调控网络分析)[J].中国媒介生物学及控制杂志,2022(02):191-200
A类:
mRNA470,mRNA481
B类:
白纹伊蚊,性别差异,miRNA,调控网络分析,差异表达,靶基因,关键基因,明白,性别分化,调控机制,文库,测序分析,生物信息学方法,叠筛,互作关系,关系网络,网络图,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,功能富集分析,性别特异性,雌性,特异表达,低表达,雄性特异,互作网络,生殖功能,直接参与,获得性
AB值:
0.218844
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