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新疆新源县多房棘球蚴病病例特征及其病原基因多态性分析
文献摘要:
目的 了解新疆新源县人群多房棘球蚴病(AE)病例特征及其病原基因多态性情况,为制定AE预防控制策略提供参考.方法 收集2016—2020年新疆医科大学第一附属医院生物样品库中新源县AE患者的病例信息及其手术切除的肝脏病灶样品,提取肝脏病灶样品基因组DNA,PCR扩增线粒体NADH脱氢酶2(nad2)基因并测序,PCR产物经测序剪接后进行BLAST比对,用MEGA10.0软件采用邻接法构建系统进化树,DnaSPv5软件分析扩增序列的基因型,Network10.0软件制作nad2基因型网络图.结果 共收集AE病例28例,其中农区7例,巩乃斯河两岸流域21例;男性17例,女性11例,二者差异无统计学意义(χ2=0.704,P>0.05);民族分布中,汉族12例、哈萨克族11例、维吾尔族3例、蒙古族1例、其他民族1例;职业分布中以农牧民为主,占92.86%(26/28),其他职业仅占7.14%(2/28),不同职业间病例数差异有统计学意义(χ2=3.89,P<0.05);年龄分布中以20~49岁年龄组为主,占78.57%(22/28),其他年龄组占21.43%(6/28),不同年龄组间病例数差异无统计学意义(χ2=0.418,P>0.05).25份多房棘球蚴肝组织病灶样品PCR扩增出大小约1031 bp的片段,与预期大小一致,另3份未扩增出条带.序列比对结果显示,25条序列分属H1、H2、H3和H4等4个基因型,其中H1为主要基因型(占72.0%,18/25),与哈萨克斯坦(GenBank登录号AB461406)分离株序列一致性为100%.系统进化树结果显示,新源县病例分离株的4个基因型与波兰(GenBank登录号KY205700)和哈萨克斯坦(GenBank登录号AB461406)分离株在同一条分支上,但与法国(GenBank登录号AB461404)、奥地利(GenBank登录号AB461403)、加拿大(GenBank登录号JF751036)、美国阿拉斯加(GenBank登录号MT429275)、美国印第安纳(GenBank登录号AB461409)及中国内蒙古(GenBank登录号AB461411)分离株亲缘关系较远.基因型网络图结果显示,以H1为中心,H2、H3、H4、中国四川,波兰、加拿大及日本分离株呈散射状分布,表明这些分离株均与H1亲缘关系较近,但与法国、奥地利、加拿大,美国阿拉斯加等序列不在同一分支,亲缘关系较远.结论 本研究分析的28例AE患者主要为汉族和哈萨克族,农牧民占比较高,AE患者样品共有4个基因型,其中H1属新源县主要基因型.
文献关键词:
多房棘球蚴病;新源县;nad2基因;基因型
中图分类号:
作者姓名:
才仁;任远;米荣升;郭刚;齐文静;张壮志;郭宝平
作者机构:
新疆医科大学第一附属医院,临床医学研究院,乌鲁木齐 830011;新疆医科大学省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室,乌鲁木齐 830011;中国农业科学院上海兽医研究所,农业部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室(上海)农业部动物寄生虫学重点实验室,上海 200241;新疆畜牧科学院兽医研究所(新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院) ,乌鲁木齐 830013
文献出处:
引用格式:
[1]才仁;任远;米荣升;郭刚;齐文静;张壮志;郭宝平-.新疆新源县多房棘球蚴病病例特征及其病原基因多态性分析)[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2022(02):181-186
A类:
MEGA10,DnaSPv5,Network10,巩乃斯河,AB461406,KY205700,AB461404,AB461403,JF751036,MT429275,AB461409,AB461411
B类:
新疆新源县,多房棘球蚴病,病例特征,原基,基因多态性,多态性分析,AE,预防控制,新疆医科大学,生物样品,病例信息,手术切除,NADH,nad2,剪接,BLAST,邻接,接法,建系,系统进化树,基因型,软件制作,网络图,共收,中农,农区,两岸,汉族,哈萨克族,维吾尔族,蒙古族,农牧民,年龄分布,不同年龄组,肝组织,bp,条带,序列比对,分属,H1,H2,H3,H4,哈萨克斯坦,GenBank,登录号,分离株,序列一致性,波兰,奥地利,加拿大,阿拉斯加,印第安纳,亲缘关系,较远,国四,加等
AB值:
0.194706
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