目的 基于宏基因组二代测序(mNGS)诊断的鹦鹉热衣原体肺炎的相关数据,分析其流行病学特征.方法 由微远基因科技有限公司和迪飞医学科技有限公司提供宏基因组二代测序数据,分别为数据集Ⅰ(2019年11月至2021年1月)和数据集Ⅱ(2019年4月至2020年12月),包括:鹦鹉热衣原体检测阳性患者的性别、年龄、所在城市、检测标本种类、检测时间、检测鹦鹉热衣原体的DNA序列数以及相应时间段内进行mNGS检测的肺炎患者病例数.数据纳入统计学软件进行分析.结果 共检标本11514例,阳性患者132例,检出率为1.1％(132/11514).春季和夏季共44例,占总病例数的33.3％.秋季和冬季88例,占总病例数的66.7％.北方患者群感染鹦鹉热衣原体阳性检出率为0.5％(9/1756),南方患者群阳性检出率为1.3％(123/9758).132例阳性病例主要由呼吸科、重症医学科、急诊科和感染科收治,占总病例数的94.7％ (125/132).来源于阳性病例的标本数量179个,其中肺泡灌洗液、血液和痰液共172个,占96.1％(172/179).肺泡灌洗液标本阳性率高,数据集Ⅰ和数据集Ⅱ分别为100％和96.8％;而血液标本的阳性率稍低,分别为81.3％和67.6％.结论 鹦鹉热衣原体肺炎发病率较高的季节在秋冬季,我国秦岭淮河以南地区的检出率高于秦岭淮河以北地区.用于检测的标本,首选为肺泡灌洗液.

宏基因组二代测序;鹦鹉热衣原体;肺炎;流行病学特征

陆晓旻;朱际平;陈扬;戴海宁

南京中医药大学附属医院江苏省中医院呼吸与危重症医学科,江苏南京210029;迪飞医学科技有限公司,江苏南京210000;微远基因科技有限公司,广东广州510000

中国临床研究

[1]陆晓旻;朱际平;陈扬;戴海宁-.基于宏基因组二代测序诊断的鹦鹉热衣原体肺炎的流行病学特征分析)[J].中国临床研究,2022(01):1-5

基于宏基因组二代测序,鹦鹉热衣原体肺炎,流行病学特征分析,mNGS,基因科技,医学科技,序数,所在城市,本种,检测时间,肺炎患者,入统,体阳,阳性检出率,阳性病例,呼吸科,重症医学科,急诊科,感染科,肺泡灌洗液,痰液,血液标本,稍低,秋冬季,秦岭,淮河,选为

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