典型文献
转录组测序分析虾青素对肝癌HepG2细胞的抑制作用
文献摘要：
目的 探讨虾青素处理肝癌细胞后的基因表达差异,并对其进行生物学信息分析.方法 虾青素处理细胞后,用TRIzol试剂提取RNA,选用Illumina TruseqTM RNA sample prep Kit方法进行文库构建、测序,最后进行差异表达基因及功能富集分析.结果 转录组测序得到对照组和处理组总的数据量分别有39642566和497155920条,过滤得到各组数据量所占比例分别为94.89％和93.56％,共检测到77344个转录本,有统计学差异表达基因4997个,其中上调的基因1564个,下调的基因3433个.结论 虾青素通过影响多个与代谢相关的生物学进程和信号通路,其中抑制翻译过程可能在虾青素调控肝癌的生长抑制过程中发挥主要作用.
文献关键词：
虾青素;肝细胞癌;转录组测序
中图分类号：
作者姓名：
徐欢;王广丽;李庭明;王玮;董丹丹
作者机构：
430071 武汉,武汉市第七医院感染性疾病科
文献出处：
引用格式：
[1]徐欢;王广丽;李庭明;王玮;董丹丹-.转录组测序分析虾青素对肝癌HepG2细胞的抑制作用)[J].肿瘤防治研究,2022(06):581-585
A类：
TruseqTM
B类：
转录组测序分析,虾青素,HepG2,素处理,肝癌细胞,基因表达差异,生物学信息分析,TRIzol,Illumina,sample,prep,Kit,文库构建,差异表达基因,功能富集分析,数据量,转录本,统计学差异,翻译过程,生长抑制,肝细胞癌
AB值：
0.332455
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
