目的 基于宏基因组学测序探究健康成人唾液和龈上菌斑微生态的物种组成及功能基因代谢途径,为口腔疾病的生物学防治提供参考.方法 采集健康成人唾液和龈上菌斑样本,分别提取样本总DNA,构建宏基因组文库,对合格的文库进行宏基因组学测序,并对测序数据进行生物信息学及统计学分析.结果 健康口腔样本主要菌门为变形菌门(32.51％)、拟杆菌门(30.81％)、放线菌门(16.23％)等,主要菌种为马氏棒状杆菌(3.84％)、副流感嗜血菌(2.91％)、产黑色素普雷沃菌(2.76％)等;龈上菌斑组的Alpha多样性高于唾液组,且两组间微生物群落构成存在明显差异(P<0.05).在种水平上,唾液样本中产黑色素普雷沃菌、牙周梭杆菌、中间普雷沃菌等较龈上菌斑样本丰富,而龈上菌斑样本中马氏棒状杆菌、产酸丙酸杆菌、龋齿罗氏菌等比唾液样本丰富(P<0.05).基于宏基因组学测序构建了健康成人唾液及龈上菌斑的高质量基因集.KEGG通路功能代谢差异结果显示唾液微生物中淀粉与蔗糖代谢、亮氨酸和异亮氨酸降解、精氨酸生物合成等较龈上菌斑丰富,而龈上菌斑中糖酵解/糖合成、碳代谢等较唾液丰富.结论 健康成人唾液和龈上菌斑微生态的物种组成及功能基因代谢途径存在明显差异,不同微生态区的优势物种对识别口腔疾病的敏感性可能不同,在口腔疾病微生物研究中,应根据研究疾病的不同选择合适的样本.

宏基因组学;高通量测序;唾液;龈上菌斑;口腔微生物;口腔微生态;微生物多样性;产黑色素普雷沃菌;马氏棒状杆菌;功能基因;代谢;口腔疾病

李玉姣;程小刚;钱飞;潘雅婷;陈力元;田宇

军事口腔医学国家重点实验室 口腔疾病国家临床医学研究中心 陕西省口腔医学重点实验室 第四军医大学口腔医院牙体牙髓病科,陕西西安 710032;军事口腔医学国家重点实验室 口腔疾病国家临床医学研究中心 陕西省口腔医学重点实验室 第四军医大学口腔医院修复科,陕西 西安 710032

口腔疾病防治

[1]李玉姣;程小刚;钱飞;潘雅婷;陈力元;田宇-.健康成人口腔微生物组成及功能的宏基因组学研究)[J].口腔疾病防治,2022(08):533-541

马氏棒状杆菌,产酸丙酸杆菌

健康成人,口腔微生物组,微生物组成,组学研究,宏基因组学测序,龈上菌斑,物种组成,功能基因,代谢途径,口腔疾病,文库,序数,统计学分析,变形菌门,拟杆菌门,放线菌,菌种,副流感,嗜血,产黑色素普雷沃菌,Alpha,微生物群落,群落构成,牙周,梭杆菌,中马,龋齿,罗氏,功能代谢,代谢差异,唾液微生物,蔗糖代谢,异亮氨酸,精氨酸,生物合成,糖酵解,碳代谢,生态区,优势物种,口腔微生态,微生物多样性

0.203403