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典型文献
龈上菌斑微生物与宿主血脂水平的相关性分析
文献摘要:
目的:分析龈上菌斑微生物与宿主血脂水平的相关性.方法:采集68名45~60岁志愿者的龈上菌斑样本,提取总DNA并对其16S rDNA V3-V4区进行PCR扩增.扩增所得产物经Illumina MiSeq PE300平台测序后,进行OTU聚类、物种注释,并将注释到的物种(属水平)与宿主血脂水平作Spearman相关分析.采用SPSS 16.0软件包对数据进行统计学分析.结果:68名志愿者的龈上菌斑样本测序所得平均序列数为41929条,聚类所得OTU数为1037,共注释到25个门,45个纲,92个目,155个科和330个属.物种聚类热图显示68个样本具有相似的物种组成丰度模式.Spearman相关分析显示:在龈上菌斑微生物中,拟普雷沃菌属、小类杆菌属、消化链球菌属和普雷沃菌属7与宿主血清总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇水平呈负相关;宿主血清高密度脂蛋白胆固醇水平与奈瑟菌属的丰度呈正相关,但与普雷沃菌属2的丰度呈负相关.结论:人群中龈上菌斑微生物的组成结构具有稳定性,与宿主血脂水平相关,可进一步探究龈上菌斑微生物作为宿主脂代谢状态的生物标志物.
文献关键词:
龈上菌斑;微生物;血脂水平;16S rDNA测序;Spearman相关分析
作者姓名:
赵芬;董婷;苑克勇;晋巧巧;黄正蔚;马瑞
作者机构:
上海交通大学医学院附属第九人民医院 牙体牙髓病科,上海交通大学口腔医学院,国家口腔医学中心,国家口腔疾病临床医学研究中心,上海市口腔医学重点实验室,上海 200011
文献出处:
引用格式:
[1]赵芬;董婷;苑克勇;晋巧巧;黄正蔚;马瑞-.龈上菌斑微生物与宿主血脂水平的相关性分析)[J].上海口腔医学,2022(04):395-399
A类:
B类:
龈上菌斑,宿主,血脂水平,16S,rDNA,V3,V4,Illumina,MiSeq,PE300,OTU,平作,软件包,统计学分析,热图,物种组成,普雷沃菌属,杆菌属,链球菌属,血清总胆固醇,低密度脂蛋白胆固醇,血清高密度脂蛋白,高密度脂蛋白胆固醇,奈瑟菌属,组成结构,脂代谢,代谢状态,生物标志物
AB值:
0.244047
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