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甲基化数量性状定位分析microRNA-122 rs1135519多态性与肿瘤遗传易感性
文献摘要：
目的:基于公共数据库中microRNA-122(miR-122)DNA甲基化和基因多态性分型数据，探讨rs1135519 T>C多态性与肿瘤遗传易感性的关系。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)和泛癌种甲基化数量性状位点(Pan-cancer methylation quantitative trait loci，Pancan-meQTL)数据库，关联分析rs1135519基因型与其上下游1 Mb区域内CpG位点的甲基化修饰水平的相关性。结果:线性回归分析结果发现，rs1135519 T>C与子宫体子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma，UCEC)、膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma，BLCA)、结直肠癌(colorectal cancer，CRC)、胃腺癌(stomach adenocarcinoma，STAD)等9种肿瘤患者组织中miR-122基因启动子区cg19165390、cg12907477或cg19312305 CpG位点的甲基化状态显著相关，差异具有统计学意义(
P<0.001)。
结论:rs1135519 T>C可能作为meQTL位点，通过影响miR-122启动子区DNA甲基化修饰状态调控肿瘤的发生发展。
文献关键词：
microRNA-122;rs1135519;DNA甲基化;甲基化数量性状位点
中图分类号：
作者姓名：
王雨坤;杨海丽;黎宏勇;江敏;苏良;陈英妮;相梦妍;于祥远
作者机构：
桂林医学院科学实验中心，桂林 541199;桂林医学院公共卫生学院预防医学研究所，桂林 541199
文献出处：
引用格式：
[1]王雨坤;杨海丽;黎宏勇;江敏;苏良;陈英妮;相梦妍;于祥远-.甲基化数量性状定位分析microRNA-122 rs1135519多态性与肿瘤遗传易感性)[J].国际遗传学杂志,2022(01):1-6
A类：
rs1135519,甲基化数量性状位点,Pancan,meQTL,cg19165390,cg12907477,cg19312305
B类：
数量性状定位,定位分析,microRNA,遗传易感性,公共数据库,miR,基因多态性分型,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,泛癌,cancer,methylation,quantitative,trait,loci,基因型,上下游,Mb,CpG,甲基化修饰,子宫体,子宫内膜癌,uterine,corpus,endometrial,UCEC,膀胱尿路上皮癌,bladder,urothelial,BLCA,结直肠癌,colorectal,CRC,胃腺癌,stomach,adenocarcinoma,STAD,肿瘤患者,患者组织,基因启动子区,甲基化状态
AB值：
0.316064
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