典型文献
哈茨木霉酸性蛋白酶P6281的结构分析
文献摘要:
利用生物信息学网站、软件对哈茨木霉酸性蛋白酶P6281进行了预测和分析.结果表明,P6281属于ClanAA中A1家族的天冬氨酸蛋白酶,一级结构是由386个氨基酸残基组成的序列,其中序列的氨基酸残基1~17位为信号肽、18~65位为前导肽、66~386位为成熟肽.以来源于Irpex lacteus的天冬氨酸蛋白酶(PDB code:1wkr.1.A)为模板进行同源建模;从构建的P6281模型中可知,P6281二级结构主要由β折叠以及少量的简短α螺旋结构组成.三级结构由类二重对称的N-lobe和C-lobe形成,该结构中无丝氨酸和脯氨酸形成的顺式肽键、loop环中无脯氨酸残基、无Zn离子结合、含有1个二硫键、270个氢键.N-lobe和C-lobe相结合的缝隙即为P6281的底物结合区域(分为S2'、S1'、S1、S2、S3和S4),其中S1'、S1、S3和S4对其底物选择性具有关键性作用;并且底物结合区域中重要位点的氨基酸残基的保守性和差异性,决定了P6281对底物肽键选择性的独特性.
文献关键词:
哈茨木霉;酸性蛋白酶P6281;结构分析
中图分类号:
作者姓名:
柯野;屈奇奇;李昊然
作者机构:
韶关学院英东生物与农业学院,广东韶关 512005
文献出处:
引用格式:
[1]柯野;屈奇奇;李昊然-.哈茨木霉酸性蛋白酶P6281的结构分析)[J].韶关学院学报,2022(06):55-60
A类:
P6281,ClanAA,1wkr
B类:
哈茨木霉,酸性蛋白酶,利用生物,A1,天冬氨酸蛋白酶,氨基酸残基,基组,信号肽,前导,Irpex,lacteus,PDB,code,行同,同源建模,二级结构,折叠,简短,螺旋结构,结构组成,三级结构,二重,lobe,丝氨酸,脯氨酸,顺式,肽键,loop,环中,离子结合,二硫键,氢键,缝隙,即为,底物,S2,S1,S3,S4,保守性
AB值:
0.319511
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