典型文献
基于网络药理学预测芹菜素治疗系统性红斑狼疮的机制
文献摘要:
目的 通过网络药理学预测芹菜素治疗系统性红斑狼疮(SLE)的潜在靶点以及涉及的信号通路.方法 通过SwissTargetPrediction及PharmMapper数据库预测芹菜素的潜在靶点,用OMIM、GeneCards、DrugBank和PharmGKB等数据库收集SLE疾病相关靶点.从STRING数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI),并运用Cytoscape 3.8.2软件绘制芹菜素-SLE的PPI图,并筛选核心靶点.基于DAVID数据库和Bioconductor生物信息软件包对共同靶点进行基因功能(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.通过双荧光素酶报告基因实验验证芹菜素对所筛选通路的调控作用.结果 共筛选出芹菜素潜在靶点77个,SLE相关靶点1016个,芹菜素-SLE共同靶点21个,其中核心靶点3个:ALB、HSP90AA1、ESR1;GO分析结果包括37条生物学功能、12条细胞组成过程和26条分子功能过程;KEGG通路分析显示与12条通路相关,主要涉及雌激素信号通路、NF-κB信号通路、精氨酸和脯氨酸代谢通路等经典通路.双荧光素酶报告基因实验结果显示芹菜素可抑制ERα、ERβ和NF-κB的转录.结论 网络药理学的研究结果提示,芹菜素治疗SLE有多靶点、多途径的特点,可以通过调控雌激素信号通路和NF-κB信号通路,从而抑制下游基因及炎症因子的表达,改善SLE.
文献关键词:
网络药理学;芹菜素;系统性红斑狼疮;作用机制
中图分类号:
作者姓名:
乐纯琰;杨国蓉;傅杭杰;高天问;丁滨;季巾君
作者机构:
浙江中医药大学生命科学学院 杭州 310053;浙江中医药大学基础医学院 杭州 310053
文献出处:
引用格式:
[1]乐纯琰;杨国蓉;傅杭杰;高天问;丁滨;季巾君-.基于网络药理学预测芹菜素治疗系统性红斑狼疮的机制)[J].浙江中西医结合杂志,2022(06):505-510
A类:
B类:
网络药理学预测,芹菜素,系统性红斑狼疮,SLE,潜在靶点,SwissTargetPrediction,PharmMapper,OMIM,GeneCards,DrugBank,PharmGKB,疾病相关,STRING,蛋白质相互作用,相互作用关系,PPI,Cytoscape,核心靶点,DAVID,Bioconductor,生物信息软件,软件包,基因功能,京都基因与基因组百科全书,通路富集分析,双荧光素酶报告基因实验,ALB,HSP90AA1,ESR1,生物学功能,细胞组成,通路分析,雌激素信号通路,精氨酸,脯氨酸代谢,代谢通路,可抑制,ER,多靶点,多途径
AB值:
0.246228
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