典型文献
多房棘球蚴葡萄糖转运蛋白抗原表位生物信息学预测
文献摘要：
目的 通过对多房棘球蚴葡 萄糖转 运蛋白(Echinococcus multilocularis glucose transporter,EmGLUT)二级结构的分析,并结合在线工具来预测优势T细胞和B细胞抗原表位.方法 从NCBI-Gen Bank库中获取EmGLUT基因的mRNA和氨基酸序列.二级结构特征预测使用SOPMA软件.使用IEDB、Syfpeithi软件分析T细胞优势抗原表位,使用Bcepred、AB-Cpred软件分析B细胞优势抗原表位.结果 分析结果显示,在EmGLUT二级结构中α螺旋比例占51.08％,β折叠比例占17.88％,β转角比例占3.73％,无规则卷曲比例占27.31％.综合5个在线软件分析结果得出EmGLUT有10个T细胞优势抗原表位和18个B细胞优势抗原表位,其中5个同时具有T-B细胞双抗原表位.结论 EmGLUT的优势T细胞和B细胞抗原表位被成功预测.
文献关键词：
多房棘球蚴;葡萄糖转运蛋白;抗原表位;T细胞;B细胞
中图分类号：
作者姓名：
王蕾;魏威;周培;冯琳;李润乐;汤锋
作者机构：
青海大学高原医学研究中心,青海省高原医学应用基础重点实验室,青海西宁810001;青海大学研究生院,青海西宁810001;青海大学基础医学部,青海西宁810016
文献出处：
引用格式：
[1]王蕾;魏威;周培;冯琳;李润乐;汤锋-.多房棘球蚴葡萄糖转运蛋白抗原表位生物信息学预测)[J].中国高原医学与生物学杂志,2022(03):200-209
A类：
EmGLUT,Syfpeithi,Bcepred,Cpred
B类：
多房棘球蚴,葡萄糖转运蛋白,抗原表位,Echinococcus,multilocularis,glucose,transporter,二级结构,NCBI,Gen,Bank,氨基酸序列,特征预测,SOPMA,IEDB,AB,折叠,无规则,卷曲,曲比,双抗
AB值：
0.234232
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