典型文献
病原宏基因组高通量测序医疗机构本地化质量评价联合研究
文献摘要：
目的:开展病原宏基因组高通量测序(mNGS)质量评价联合研究,为医疗机构(医院)mNGS本地化建设提供参考经验.方法:参加单位使用本地化建设的mNGS流程,按方案要求检测参考品标本并回报结果.对检测性能及技术选型等因素进行统计分析.结果:来自全国17个省、直辖市的42家医院的47个科室参加本次研究,检测流程包括3种测序平台的10种测序仪.参加单位按研究方案完成质量评价参考品的测试,共回报49组有效数据,其中全部性能指标均为满分的占29％,各性能指标的满分占比分别为阳性符合率(准确性)73％、阴性符合率(特异性)92％、重复性47％、检出限71％,以及稳健性37％.实验流程中标本前处理、病原富集及核酸片段化的技术选型,是显著影响满分率的因素.更大的测序数据量与满分率呈正相关,而不同测序方案则无统计学差异.结论:本次联合研究提示,目前mNGS流程的整体稳定性仍有较大优化空间,实验室在开展本地化建设时应充分考虑影响检测系统稳定的各潜在因素,有助于保证日常运行的稳定可控.
文献关键词：
病原宏基因组高通量测序;医疗机构;本地化;质量评价;参考品
中图分类号：
作者姓名：
刘东来;张栋;韩东升;艾静文;关文达;胡晋君;李曼郁;周海卫;王佑春;吴文娟;许四宏
作者机构：
中国食品药品检定研究院;中国医学科学院北京协和医院检验科;复旦大学附属华山医院感染科;广州医科大学附属第一医院广州呼吸健康研究院
文献出处：
引用格式：
[1]刘东来;张栋;韩东升;艾静文;关文达;胡晋君;李曼郁;周海卫;王佑春;吴文娟;许四宏-.病原宏基因组高通量测序医疗机构本地化质量评价联合研究)[J].中国食品药品监管,2022(12):4-15
A类：
B类：
病原宏基因组高通量测序,本地化,联合研究,mNGS,参考品,检测性能,直辖市,科室,检测流程,测序平台,研究方案,完成质量,有效数据,满分,分占,符合率,检出限,中标,前处理,核酸片段,片段化,分率,序数,数据量,统计学差异,整体稳定性,系统稳定,日常运行
AB值：
0.258565
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