典型文献
红豆杉叶际共生菌参与紫杉醇合成的宏基因组学分析
文献摘要：
本实验以红豆杉叶为唯一碳源进行富集培养,故富集到的菌群均为红豆杉叶际共生菌,以排除其他杂菌的干扰.而后通过宏基因组技术分析其菌种组成,并证实这些菌种与紫杉醇合成代谢的关系.分析结果:物种注释显示Ascomycota(子囊菌门)为样本的绝对优势菌门,优势菌属有Wickerhamomyces(威克罕默氏属)、Clavis-pora(棒孢酵母属)等,Wickerhamomycesanomalus(威克罕默氏菌)、Clavisporalusitaniae(葡萄牙棒孢酵母)、Meyerozymaguilliermondii(季也蒙念珠菌)、Aspergillusnidulans(构巢曲霉)等为样品的优势菌种;经KEGG数据库分析表明,样本的功能基因主要位于氨基酸代谢(Amino acid metabolism)和碳水化合物代谢(Carbohydrate metabolism)中,这2个代谢通路不仅与菌种的生长和存活密不可分,也为紫杉醇的合成提供前体物质.在紫杉醇合成代谢途径中,能够分泌相关酶的微生物均处于子囊菌门,且其中也存在Clavispora lusitaniae(葡萄牙棒孢酵母)这一优势菌种,故推测样本中检测到的菌种能够参与紫杉醇的合成代谢;基于CAZy数据库的结果表明,样本中有6类碳水化合物活性酶的活性较高,这些碳水化合物活性酶均属于糖苷水解酶和糖苷转移酶.在微生物的次级代谢过程中,糖基化是重要的反应,可以改变某些抗生素和紫杉醇的特性,从而使其发挥更大的作用.为后续对合成紫杉醇的菌种的筛选具有指导意义,以期缩短提取紫杉醇的时间,提高提取率.
文献关键词：
紫杉醇;叶际共生菌;宏基因组;微生物多样性;功能基因
中图分类号：
作者姓名：
董华恒;温欣;于淼;陈营
作者机构：
烟台大学生命科学学院,山东 烟台264005
文献出处：
引用格式：
[1]董华恒;温欣;于淼;陈营-.红豆杉叶际共生菌参与紫杉醇合成的宏基因组学分析)[J].农业与技术,2022(12):4-9
A类：
叶际共生菌,Clavis,Wickerhamomycesanomalus,Clavisporalusitaniae,Meyerozymaguilliermondii,Aspergillusnidulans,Clavispora,lusitaniae
B类：
红豆杉,紫杉醇,宏基因组学,基因组学分析,唯一碳源,富集培养,杂菌,合成代谢,Ascomycota,子囊菌门,绝对优势,威克,酵母,葡萄牙,念珠菌,构巢曲霉,优势菌种,数据库分析,功能基因,氨基酸代谢,Amino,acid,metabolism,碳水化合物代谢,Carbohydrate,代谢通路,前体物质,代谢途径,CAZy,碳水化合物活性酶,糖苷水解酶,转移酶,次级代谢,代谢过程,糖基化,高提取率,微生物多样性
AB值：
0.229008
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