典型文献
苹果砧木T337不同组织内生菌群落及其功能预测
文献摘要：
应用高通量测序技术分析苹果砧木T337根部、枝部、叶部的内生菌群落并利用PICRUSt进行功能预测.从苹果砧木T337不同部位的内生细菌中共获得的有效序列聚类为11386个操作分类单元(OTUs).从内生真菌中获得的有效序列聚类为2718个OTUs.α-多样性分析结果表明,各指数均为根部显著高于枝部、叶部,枝部、叶部间的差异则不显著;从内生真菌多样性上看,除辛普森(Simpson)指数表现为根部、叶部显著高于枝部外,其他指数均表现为根>叶>枝.物种丰度分析结果表明,在门水平上,T337根部的最优细菌门为放线菌门(Actinobacteria),枝部、叶部的最优细菌门为变形菌门(Proteobacteria);在属水平上,T337根部、枝部、叶部最具优势的内生细菌分别为变形菌门的鞘氨醇单胞属(Sphingomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、甲基杆菌属(Methylobacterium);根部的特有菌属最多,有187个,枝部有5个,叶部有6个.T337根部、枝部、叶部都存在大量未归类的内生细菌(占比分别为35.885％、50.185％、59.884％).根、枝、叶3个部位最优势真菌门均为子囊菌门(Ascomycota),内生真菌优势属分别为子囊菌门的亚隔孢属(Didymella)、Knufia(尚无统一的中文名)和壳针孢属(Septoria).根部内生真菌的特有属有121个,枝部样品的特有属有7个,叶部样品的特有属有35个.根、枝、叶中也存在大量未归类的内生真菌(占比分别为41.031％、82.036％、39.467％).功能预测结果显示,苹果砧木T337内生细菌群落功能与植物组织部位发挥的功能一致,可为进一步挖掘与植物营养生长相关微生物提供参考.
文献关键词：
苹果砧木T337;高通量测序;内生微生物;功能预测;α-多样性分析
中图分类号：
作者姓名：
程欢;张东华;张俊忠;刘丽
作者机构：
西南林业大学保护生物学学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明650224
文献出处：
引用格式：
[1]程欢;张东华;张俊忠;刘丽-.苹果砧木T337不同组织内生菌群落及其功能预测)[J].江苏农业科学,2022(14):144-154
A类：
Knufia
B类：
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AB值：
0.335391
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