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典型文献
百蕊草LRR-RLKs基因的鉴定与生物信息学分析
文献摘要:
以百蕊草(Thesium chinense Turcz)为材料,根据硝酸银诱导的转录组数据,PCR克隆到两条LRR-RLK基因,通过测序、生物信息学分析、荧光定量PCR等技术对两条基因进行分析.结果发现,两条基因全长分别为1 278 bp与2 115 bp,分别编码425和704个氨基酸,命名为TcLRR1和TcLRR2;TcLRR1与拟南芥EFR基因一致性最高,TcLRR2与水稻Xa21一致性最高;TcLRR2具有完整的LRR-RLK蛋白结构(亮氨酸重复域、信号肽、跨膜结构域、激酶域),而TcLRR1缺乏激酶域;TcLRR1与TcLRR2在非胁迫条件下的组织表达模式一致,都在叶片中表达最高.综上所述,TcLRR2可作为百蕊草抗逆相关的LRR-RLK候选基因进行后续的深入研究.
文献关键词:
百蕊草;基因;LRR-RLK;TcLRR1;TcLRR2;生物信息学
作者姓名:
张文香;常子丽;李芳;杨香香;丁波;曹剑锋
作者机构:
贵州师范学院生物科学学院药用植物技术研究所,贵州贵阳550018;衡水学院生命科学学院,河北衡水053000
文献出处:
引用格式:
[1]张文香;常子丽;李芳;杨香香;丁波;曹剑锋-.百蕊草LRR-RLKs基因的鉴定与生物信息学分析)[J].南方农业,2022(09):1-6
A类:
Thesium,TcLRR1,TcLRR2
B类:
百蕊草,RLKs,生物信息学分析,chinense,Turcz,硝酸银,转录组数据,全长,bp,分别编,拟南芥,EFR,水稻,Xa21,蛋白结构,亮氨酸,信号肽,跨膜结构域,激酶域,胁迫条件,组织表达模式,综上所述,抗逆,候选基因
AB值:
0.269633
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