典型文献
基于TCGA数据库分析VEGFA在结肠癌中的表达及薏苡仁的干预研究
文献摘要：
目的:基于TCGA分析筛选出的关键基因mRNA在结肠癌组织中的表达并探讨薏苡仁对其干预作用.方法:基于TCGA数据库分析TP53、MYC、VEGFA、JUN、MMP9、TNF和EGFR基因在结肠癌患者中的表达状态;采用GEPIA数据库对TP53、MYC、VEGFA、EGFR、MMP9、JUN基因进行Kaplan-Meier生存分析和Log-rank P检验;选择与结肠癌预后相关的基因VEGFA和EGFR探讨其与临床分期和多种临床病理特征的关系;采用Cox比例风险回归模型对与临床病理相关的基因VEGFA进行单因素和多因素分析,分子对接技术分析薏苡仁与VEGFA的结合情况.结果:共筛选出174个结肠癌的靶标基因,TP53、MYC、VEGFA、JUN、MMP9、TNF和EGFR为核心基因.TCGA数据库中筛选出473例结肠癌样品和41例癌旁样品,TP53、MYC、VEGFA、JUN、MMP9和EGFR mRNA表达值在结肠癌和癌旁组织中差异具有统计学意义(P≤0.01).VEGFA、EGFR基因表达量与COAD预后的差异具有统计学意义(P<0.05);VEGFA表达量与N分期呈正相关(P<0.05);单因素分析发现,年龄、临床分期及T、N、M分期能够影响结肠癌患者的预后(P<0.05);COX多因素回归分析结果提示,年龄、T分期是影响结肠癌患者预后的独立因素(P<0.05).通过分子对接分析发现,薏苡仁中16个化学成分与VEGFA有较好的结合(T_Score>5).结论:VEGFA与结肠癌发生、发展和预后关系密切,薏苡仁对其具有干预作用.
文献关键词：
结肠癌;VEGFA;预后;网络药理学;薏苡仁
中图分类号：
作者姓名：
李周瑜;杨欣;张迎;石昌菊;金继华
作者机构：
贵州中医药大学基础医学院,贵州 贵阳 550025
文献出处：
引用格式：
[1]李周瑜;杨欣;张迎;石昌菊;金继华-.基于TCGA数据库分析VEGFA在结肠癌中的表达及薏苡仁的干预研究)[J].中医药信息,2022(10):28-34
A类：
B类：
TCGA,数据库分析,VEGFA,薏苡仁,干预研究,关键基因,结肠癌组织,干预作用,TP53,MYC,JUN,MMP9,EGFR,结肠癌患者,GEPIA,Kaplan,Meier,生存分析,Log,rank,临床分期,临床病理特征,Cox,病理相关,多因素分析,分子对接技术,靶标基因,核心基因,癌旁组织,基因表达量,COAD,COX,多因素回归分析,个化,Score,预后关系,网络药理学
AB值：
0.23436
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