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典型文献
ddPCR与ARMS-PCR检测NSCLC患者EGFR基因T790M突变的比较研究
文献摘要:
目的:通过对比微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)和突变扩增阻滞系统PCR(amplification refrac-tory mutation system PCR,ARMS-PCR)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)表皮生长因子受体(epi-dermal growth factor receptor,EGFR)基因T790M突变的检测效能,综合分析两种检测方法的优势及适用范围.方法:回顾性收集115例NSCLC患者的标本,同时使用ddPCR和ARMS-PCR两种方法检测EGFR基因T790M突变状态,比较两种方法的检测结果,并分析不同样本类型对ddPCR检测结果的影响.结果:ddPCR检测T790M阳性率为65.2%,ARMS-PCR阳性率为27.8%,ddPCR检测敏感性显著高于ARMS-PCR(P<0.05),两种方法检测一致率为62.6%.ddPCR+ARMS-样本的T790M平均阳性微滴数和平均突变丰度(11,0.35%)均显著低于ddPCR+ARMS+样本(632.3,17.7%).ddPCR检测基因组DNA和外周血游离DNA阳性率分别为55.9%和78.7%,不同样本类型T790M突变阳性微滴数和突变丰度无显著差别.结论:ddPCR和ARMS-PCR均可用于NSCLC患者EGFR基因T790M突变检测,二者具有良好的一致性,ddPCR具有更高的灵敏性,在检测突变丰度较低的样本方面具有优势.
文献关键词:
EGFR基因;T790M突变;ddPCR;ARMS-PCR;非小细胞肺癌
作者姓名:
李月;徐玉霞
作者机构:
510060 广州,中山大学肿瘤防治中心 华南肿瘤学国家重点实验室,肿瘤医学协同创新中心
文献出处:
引用格式:
[1]李月;徐玉霞-.ddPCR与ARMS-PCR检测NSCLC患者EGFR基因T790M突变的比较研究)[J].肿瘤预防与治疗,2022(03):211-216
A类:
ddPCR+ARMS,ddPCR+ARMS+
B类:
NSCLC,EGFR,T790M,droplet,digital,amplification,refrac,tory,mutation,system,非小细胞肺癌,small,cell,lung,cancer,表皮生长因子受体,epi,dermal,growth,receptor,本类,一致率,突变检测,灵敏性
AB值:
0.213743
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