典型文献
基于KEGG通路和蛋白相互作用网络筛选舒张性心力衰竭关键靶点基因
文献摘要:
目的 运用KEGG通路和蛋白相互作用网络筛选舒张性心力衰竭的靶点基因.方法 以"Heart failure with preserved ejection fraction"为关键词在Genecard数据库中检索舒张性心力衰竭的靶点基因,并运用R语言相关数据包进行KEGG通路分析,获取舒张性心力衰竭的关键通路及关键基因,于STRING网站上传基因,建立关键基因的蛋白质相互作用网络,筛选出舒张性心力衰竭的核心靶点基因.结果 检索到526个舒张性心力衰竭的基因,通过KEGG富集分析,得到425个基因富集于160条信号通路,主要有PI3K-Akt信号通路,JAK-STAT信号通路等,通过蛋白互作网络得到核心基因有VEGFA、AKT、IL-6等.结论 本研究通过KEGG和蛋白质互作网络具体分析了舒张性心力衰竭的关键信号通路及核心基因,为进一步基础实验提供参考.
文献关键词:
KEGG信号通路;蛋白相互作用网络;舒张性心力衰竭;靶点基因
中图分类号:
作者姓名:
翁洁琼;原梦飞;姚婷婷;张晶芳;沈晓旭
作者机构:
100700 北京,北京中医药大学东直门医院心内科
文献出处:
引用格式:
[1]翁洁琼;原梦飞;姚婷婷;张晶芳;沈晓旭-.基于KEGG通路和蛋白相互作用网络筛选舒张性心力衰竭关键靶点基因)[J].中国循证心血管医学杂志,2022(09):1029-1033,1039
A类:
B类:
蛋白相互作用网络,舒张性心力衰竭,关键靶点,靶点基因,Heart,failure,preserved,ejection,fraction,Genecard,数据包,通路分析,关键基因,STRING,站上,蛋白质相互作用网络,核心靶点,富集分析,基因富集,PI3K,Akt,JAK,STAT,蛋白互作网络,核心基因,VEGFA,AKT,蛋白质互作网络,基础实验
AB值:
0.256506
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