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玻璃珠-涡旋振荡改良法用于硅藻DNA提取
文献摘要：
目的 检验玻璃珠-涡旋振荡改良法提升硅藻DNA提取的效果.方法 以DNeasy PowerSoil Pro试剂盒为对照,另选取2种不同原理的植物DNA提取试剂盒(新型植物基因组DNA提取试剂盒、Plant DNA Isolation试剂盒)和1种血液DNA提取试剂盒(全血基因组DNA提取试剂盒)对同一水样及同一溺死案件肺组织的硅藻DNA进行提取.设计不同大小玻璃珠质量比和涡旋振荡时间的组合,选择加入玻璃珠振荡的最佳DNA提取条件.将常规组与改良组的提取产物直接进行电泳,经硅藻特异性PCR扩增检测,采用qPCR对提取物进行定量,对各组的Ct值进行统计学分析.结果 当涡旋振荡频率为3000 r/min时,DNA提取的最佳组合为涡旋振荡4 min,大小玻璃珠质量比为1:1.以DNeasy PowerSoil Pro试剂盒的Ct值为参照,10 mL水样的Ct值大于0.5 g组织的Ct值.其他3种试剂盒采用玻璃珠-涡旋振荡改良法后,用于植物DNA提取的2种试剂盒Ct值均下降,且改良前后组织的Ct值差异均有统计学意义(P<0.05);全血基因组DNA提取试剂盒可以成功提取硅藻DNA,水样提取效果接近DNeasy PowerSoil Pro试剂盒,改良法用于组织样本后,其Ct值差异有统计学意义(P<0.05);但应用3种试剂盒对水样中硅藻DNA进行提取时,改良前后的Ct值只有新型植物基因组DNA提取试剂盒差异具有统计学意义(P<0.05).结论 玻璃珠-涡旋振荡改良法可提高植物及血液DNA提取试剂盒对法医学检材中硅藻DNA的提取效果,特别是对组织样本中硅藻DNA的提取.
文献关键词：
法医病理学;溺死;DNA提取;硅藻;玻璃珠-涡旋振荡改良法
中图分类号：
作者姓名：
蔡杰;王博;胡孙林;曲一泓;宋涛;陈建华;邓建强
作者机构：
海南医学院法医学教研室 海南省热带法医学司法鉴定工程研究中心,海南 海口 571199;深圳美恩美科技有限公司,广东 深圳 518103
文献出处：
引用格式：
[1]蔡杰;王博;胡孙林;曲一泓;宋涛;陈建华;邓建强-.玻璃珠-涡旋振荡改良法用于硅藻DNA提取)[J].法医学杂志,2022(01):119-126
A类：
PowerSoil
B类：
玻璃珠,涡旋,改良法,硅藻,DNeasy,Pro,试剂盒,另选,植物基,Plant,Isolation,全血,水样,溺死,肺组织,同大,振荡时间,选择加入,提取条件,接进,电泳,qPCR,Ct,统计学分析,振荡频率,最佳组合,提取效果,法医学,法医病理学
AB值：
0.202392
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