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典型文献
IRF4通过JAK/STAT信号通路调控糖尿病肾病炎症进展
文献摘要:
目的 筛选分析糖尿病肾病(DN)的差异表达基因(DEG),探讨IFN调节因子4(IRF4)在DN中的作用机制,为DN治疗寻找潜在的分子靶点.方法 经基因表达综合(GEO)数据库下载GSE142025数据集[包含对照组9例与进展期DN(aDN)组21例],进行DEG筛选,行基因集富集分析(GSEA)示DEG参与的分子生物学过程.使用String及Cytoscape软件可视化DEG蛋白质相互作用网络,定量逆转录PCR(RT-qPCR)和过碘酸-希夫(PAS)染色及链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶(SP)染色并进一步验证主要DEG在6例DN肾组织(DN组)和6例肿瘤切除术后癌旁正常肾组织(NC组)中的表达.结果 GEO数据库筛选出1213个差异表达mRNA,其中684个上调、529个下调.GSEA及京都基因和基因组百科全书分析显示aDN组DEG在酪氨酸激酶/信号转导及转录激活因子信号通路、趋化因子信号通路、Fcγ受体介导巨噬细胞的吞噬作用信号通路、白细胞跨内皮迁移、T细胞受体信号通路明显富集.DN组肾组织中IRF4、信号淋巴细胞活化分子6和IL-2受体α亚基mRNA相对表达量均高于NC组肾组织(P均<0.001),PAS及SP染色结果与RT-qPCR一致.结论 GSEA功能富集显示炎症相关通路活跃,而IRF4在DN组织中作为中枢基因表达上调,其可能参与高活跃炎症通路促进DN进展.
文献关键词:
糖尿病肾病;炎症;免疫;干扰素调节因子4;差异表达基因;JAK激酶/信号转导及转录激活因子通路
作者姓名:
邱月;董兰;赵升;秦曙光;何凤
作者机构:
510180 广州,华南理工大学附属第二医院肾内科
文献出处:
引用格式:
[1]邱月;董兰;赵升;秦曙光;何凤-.IRF4通过JAK/STAT信号通路调控糖尿病肾病炎症进展)[J].新医学,2022(08):555-560
A类:
GSE142025,aDN,京都基因和基因组百科全书分析
B类:
IRF4,JAK,STAT,糖尿病肾病,炎症进展,差异表达基因,DEG,IFN,分子靶点,GEO,下载,进展期,基因集富集分析,GSEA,分子生物学,生物学过程,String,Cytoscape,蛋白质相互作用网络,逆转录,qPCR,碘酸,PAS,链霉菌,生物素,SP,肾组织,肿瘤切除术,癌旁,NC,酪氨酸激酶,信号转导及转录激活因子,趋化因子,Fc,巨噬细胞,吞噬作用,跨内皮迁移,细胞受体,显富,淋巴细胞活化,亚基,相对表达量,染色结果,功能富集,相关通路,中枢基因,炎症通路,干扰素调节因子
AB值:
0.281936
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