典型文献
基于部分DNA甲基化预测肿瘤浸润免疫细胞的比例
文献摘要：
了解肿瘤组织的免疫细胞比例对肿瘤患者的诊断和预后治疗具有重要意义,DNA甲基化可以作为一种细胞分子特征来量化复杂肿瘤混合物中的多种细胞类型.本研究基于非负矩阵分解算法并结合部分DNA甲基化建立肿瘤浸润免疫细胞比例预测模型.在预测肿瘤混合物中细胞类型的比例时,选择已知的对每种免疫细胞类型差异显著的DNA甲基化水平矩阵作为特征矩阵,将其和肿瘤混合物的DNA甲基化水平输入到非负矩阵分解算法进行细胞类型的比例预测.噪声和肿瘤含量不同设置下的模拟实验验证了该模型预测的免疫细胞比例与真实比例具有很高的一致性,且均方根误差较小.将该模型应用到4种真实的肿瘤样本上,得到每种样本中浸润水平最高的免疫细胞,结果与之前其他学者的生物学发现相一致.本研究的模型能准确预测组成肿瘤混合物的细胞类型比例,为肿瘤的免疫学研究提供了新的方法.
文献关键词：
癌症;DNA甲基化;非负矩阵分解;免疫细胞
中图分类号：
作者姓名：
宋春晖;秦玉芳;陈明
作者机构：
上海海洋大学信息学院,上海201306;农业农村部渔业信息重点实验室,上海201306
文献出处：
引用格式：
[1]宋春晖;秦玉芳;陈明-.基于部分DNA甲基化预测肿瘤浸润免疫细胞的比例)[J].中国医学物理学杂志,2022(05):627-634
A类：
B类：
肿瘤浸润免疫细胞,肿瘤组织,肿瘤患者,诊断和预后,预后治疗,分子特征,混合物,细胞类型,非负矩阵分解,结合部,类型差异,甲基化水平,特征矩阵,模拟实验,模型应用,相一致,准确预测,类型比例,免疫学
AB值：
0.218822
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