典型文献
HDAC抑制剂SB939抑制三阴性乳腺癌细胞相关基因芯片分析
文献摘要：
目的 通过基因芯片技术分析三阴性乳腺癌细胞经SB939抑制剂作用后基因的差异表达.方法 选三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231接种于培养皿中培养;待细胞贴壁后,用不同浓度的SB939(0、40、60μmol·L-1)处理24 h,将收集的细胞分为3个对照组C(未经SB939处理C1～C3)及6个实验组T(低剂量组T1～T3及高剂量组T4～T6)进行RNA的提取和纯化;随后与基因芯片杂交并进行芯片图像分析,以差异≥1.5倍的标准筛选差异表达基因.结果 与对照组相比,经HDAC抑制剂SB939高剂量处理后,根据基因芯片得到的数据并分析差异表达基因,其中表达上调1.5倍的基因19个,表达下调1.5倍的基因92个;通过GSEA分析,miR-501、miR-23A、miR-23B等miRNA在表达下调基因中显著富集;通过GO富集分析发现,下调的DEGs主要富集在唾液腺形态发生发展、受体结合、蛋白结合、细胞外空隙、血小板 α 颗粒管腔、肌动蛋白丝等;通过KEGG通路富集分析,下调DEGs通路主要富集于上皮细胞的细菌侵袭途径,磷酸肌醇代谢、磷脂酰肌醇信号系统及ECM-受体相互作用途径.结论 基因芯片技术能快速有效地检测SB939抑制剂抑制三阴性乳腺癌细胞后相关基因、miRNA基因表达水平及相关信号通路的改变,为乳腺癌精准治疗提供理论依据.
文献关键词：
SB939抑制剂;三阴性乳腺癌;基因芯片;靶向治疗
中图分类号：
作者姓名：
王宝祯;凌珺;陈静;李涛
作者机构：
宁夏医科大学临床医学院,银川 750004;宁夏回族自治区生育力保持教育部重点实验室,银川 750004;宁夏医科大学基础医学院,银川 750004;宁夏医科大学总医院肿瘤医院肿瘤外二科,银川 750004
文献出处：
引用格式：
[1]王宝祯;凌珺;陈静;李涛-.HDAC抑制剂SB939抑制三阴性乳腺癌细胞相关基因芯片分析)[J].宁夏医科大学学报,2022(04):392-399
A类：
SB939,23A
B类：
HDAC,三阴性乳腺癌细胞,基因芯片技术,MB,培养皿,贴壁,C1,C3,高剂量,T4,T6,交并,芯片图像,图像分析,差异表达基因,GSEA,23B,miRNA,DEGs,唾液腺,形态发生,蛋白结合,外空,空隙,管腔,肌动蛋白,通路富集分析,上皮细胞,磷酸肌醇,磷脂酰肌醇,信号系统,ECM,作用途径,快速有效,基因表达水平,精准治疗,靶向治疗
AB值：
0.221308
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