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甲型流感病毒T细胞表位预测及HLA-A2限制性抗原肽筛选
文献摘要:
目的 通过免疫信息学技术对人类白细胞抗原(HLA)限制性甲型流感病毒T细胞表位进行预测,以期获得通用流感疫苗候选抗原肽.方法 以A/California/7/2009(H1 N1)为原始毒株,选取流感病毒保守的蛋白聚合酶复合物1(PB1)、核内部蛋白(NP)和基质蛋白1(M1)蛋白,通过免疫表位数据库(IEDB)进行HLA限制性流感病毒T细胞表位的预测、簇分析和人群覆盖率分析,将筛选出的HLA-A*02:01限制性抗原肽进行HLA-A*02:01结合的亲和力及稳定性验证.结果 共获得甲型流感病毒T细胞表位208个,包括75个PB1表位、78个NP表位及55个M1表位,达到95%以上的全球人群覆盖率;获得HLA-A*02:01限制性抗原肽6条,可覆盖全球76.98%的人群;新发现HLA-A*02:01限制性抗原肽PB1-395(LLIDGTASL),其对HLA-A*02:01分子的亲和力和稳定性均优于其他抗原肽,抗原肽PB1-39的亲和性高于M1-58(P<0.0001).结论 PB1-395(LLIDGTASL)对HLA-A*02:01分子具有较高的亲和力及稳定性,可作为通用流感疫苗候选抗原肽.
文献关键词:
甲型流感病毒;T细胞表位;HLA-A*02:01;免疫信息学
中图分类号:
作者姓名:
韩雪;寸怡娜;朱兰芳;王泯驿;卢天畅;姚宇峰;史荔;陶玉芬
作者机构:
中国医学科学院 &北京协和医学院 医学生物学研究所,云南 昆明 650118
文献出处:
引用格式:
[1]韩雪;寸怡娜;朱兰芳;王泯驿;卢天畅;姚宇峰;史荔;陶玉芬-.甲型流感病毒T细胞表位预测及HLA-A2限制性抗原肽筛选)[J].贵州医科大学学报,2022(05):530-535,541
A类:
LLIDGTASL
B类:
甲型流感病毒,细胞表位,表位预测,HLA,A2,限制性,肽筛选,免疫信息学,人类白细胞抗原,流感疫苗,候选抗原,California,H1,N1,毒株,复合物,PB1,NP,基质蛋白,M1,IEDB,覆盖率分析,亲和力,共获,新发现,亲和性
AB值:
0.238019
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