典型文献
38例临床患者留置导尿管的微生物群落多样性分析
文献摘要:
目的 通过研究患者导尿管样品中微生物群落构成,探索感染相关的潜在风险因素.方法 收集2020年11~12月期间西苑医院38例患者留置的导尿管.提取样品中的细菌总DNA,PCR扩增16S rRNA V4-V5区.利用Hiseq 2500测序平台进行测序,数据使用skewer、FLASH等软件进行细菌群落结构及多样性分析.结果 38例患者平均年龄为(82.1±7.2)岁,导尿管平均留置时间为(25.50±9.66)d.有效序列1603007条,有效序列长度在382bp至442bp之间,共得到11350个OTUs和1,668,076个优质序列.S1-S5时间段分组,各组样品中革兰氏阴性菌所占比例均高于阳性菌,36个样品存在含量>50%的优势菌门,占全部样品的86.8%.结论 导尿管为相对封闭环境,微生物群落具有特定性,导尿管中菌群变化规律总体上与留置时间相关,长留置时间可能导致高度单一菌群结构出现.
文献关键词:
泌尿道感染;留置导尿管;16S rRNA;肠球菌;铜绿假单胞菌
中图分类号:
作者姓名:
李丁;陈豪特;杨小琴;王忠;甘辛
作者机构:
中国中医科学院西苑医院 泌尿外科,北京 100091;国家食品安全风险评估中心,卫生部食品安全风险评估重点实验室,北京 100021
文献出处:
引用格式:
[1]李丁;陈豪特;杨小琴;王忠;甘辛-.38例临床患者留置导尿管的微生物群落多样性分析)[J].遵义医科大学学报,2022(03):377-382
A类:
skewer,382bp,442bp
B类:
留置导尿管,微生物群落多样性,多样性分析,群落构成,潜在风险,西苑,16S,rRNA,V4,V5,Hiseq,测序平台,数据使用,FLASH,细菌群落结构,群落结构及多样性,平均年龄,留置时间,OTUs,S1,S5,革兰氏阴性菌,阳性菌,优势菌,菌群变化,长留,菌群结构,泌尿道感染,肠球菌,铜绿假单胞菌
AB值:
0.279473
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