典型文献
基于缺氧诱导因子1信号通路治疗新型冠状病毒肺炎的潜在中药筛选及其机制研究
文献摘要:
目的:根据缺氧诱导因子1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路预测治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的潜在活性成分和中药.方法:通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库、人类基因的综合数据库(GeneCards Database)搜集HIF-1信号通路的相关基因,利用基因间功能关联关系搜索工具(Search Tool for Recurring Instances of Neighbouring Genes,STRING)数据库和 Cytoscape 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(Protein Protein Interaction,PPI)网络并筛选核心基因,然后在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索潜在治疗活性成分和中药,并构建基因-活性成分-中药网络,最后进行分子对接验证结合活性.结果:通过HIF-1信号通路中核心基因共预测出233个活性成分,439种中药.构建的基因-活性成分-中药网络中度值(Degree)最高的活性成和中药分别为槲皮素、山奈酚、木犀草素和余甘子、白果、枇杷叶、红花、苦参.分子对接结果均显示有较好的结合活性.结论:本研究通过网络药理学的方法根据HIF-1信号通路初步预测筛选了潜在的治疗活性成分及中药,为进一步探索COVID-19的治疗药物提供了理论依据.
文献关键词:
新型冠状病毒肺炎;缺氧诱导因子1信号通路;网络药理学;分子对接
中图分类号:
作者姓名:
杨洋;刘毓菲;黄青松;高培阳;张传涛;陈梅;杨洪静;王武军;肖玮
作者机构:
成都中医药大学附属医院呼吸科,四川 成都 610072;成都中医药大学附属医院重症医学科,四川 成都610072;成都市第五人民医院呼吸科,四川 成都611130
文献出处:
引用格式:
[1]杨洋;刘毓菲;黄青松;高培阳;张传涛;陈梅;杨洪静;王武军;肖玮-.基于缺氧诱导因子1信号通路治疗新型冠状病毒肺炎的潜在中药筛选及其机制研究)[J].成都中医药大学学报,2022(02):10-16
A类:
关联关系搜索,Recurring,Instances,Neighbouring
B类:
缺氧诱导因子,中药筛选,Hypoxia,Inducible,Factor,HIF,Corona,Virus,Disease,活性成分,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,人类基因,综合数据库,GeneCards,Database,Search,Tool,STRING,Cytoscape,软件构建,蛋白质相互作用,Protein,Interaction,PPI,核心基因,系统药理学,分析平台,Traditional,Chinese,Medicine,Systems,Pharmacology,Analysis,Platform,TCMSP,潜在治疗,分子对接,结合活性,预测出,Degree,槲皮素,山奈酚,木犀草素,余甘子,白果,枇杷叶,红花,苦参,网络药理学,治疗药物
AB值:
0.386485
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