典型文献
基于高通量测序技术对贵州山地野猪冬季盲肠细菌多样性分析
文献摘要：
为掌握贵州山地野猪(Sus scrofa)盲肠细菌菌群的结构功能、多样性以及菌群的地区和性别差异,揭示细菌的特异性及其与宿主的相互作用,采用16S rRNA高通量测序技术对12头贵州野猪盲肠细菌菌群进行分析,共获得有效序列59246条,经优化后以97％相似度聚类得到1256个OTU.结果表明:(1)不同地区和性别组间菌群多样性总体上差异均不显著,而在具体菌群组成上存在一定的差异菌属.(2)共聚类得到细菌18门278属,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)等6个,优势菌属有Ruminococcaceae_UCG-005、Christensenellaceae_R-7_group和Prevotellaceae_NK3B31_group等16个.(3)LEfSe分析表明,黔东南与黔北组间存在显著差异(P<0.05)的菌群为瘤胃球菌属(Ruminococcus)、乳杆菌属(Lactobacillus)和拟普雷沃氏菌属(Allopre-votella)等.(4)PICRUSt基因预测分析表明,野猪盲肠富集了44条代谢途径,以碳水化合物代谢途径为主,其次为氨基酸代谢途径.结合已有研究分析,贵州野猪盲肠细菌菌群多样性高于河南野猪、重庆圈养野猪及藏猪,不同地区、性别间均各自富集其核心菌群.研究结果为探究野猪肠道菌群如何与宿主相互作用、疾病预防和免疫发育提供基础资料,从而促进野猪的生理生化、保护管理和种群生态学等方面的研究.
文献关键词：
野猪;盲肠;肠道微生物;菌群多样性;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
彭彩淳;杨雄威;曹和琴;穆浪;王野影;胡灿实;张明明;粟海军
作者机构：
贵州大学林学院,贵阳, 550025;贵州大学生物多样性与自然保护研究中心,贵阳, 550025;贵州师范大学生命科学学院,贵阳, 550025;贵州大学生命科学学院,贵阳, 550025
文献出处：
引用格式：
[1]彭彩淳;杨雄威;曹和琴;穆浪;王野影;胡灿实;张明明;粟海军-.基于高通量测序技术对贵州山地野猪冬季盲肠细菌多样性分析)[J].野生动物学报,2022(03):654-667
A类：
Allopre,votella
B类：
高通量测序技术,贵州山地,野猪,盲肠,细菌多样性,多样性分析,Sus,scrofa,结构功能,性别差异,宿主,16S,rRNA,共获,得有,OTU,别组,菌群组成,共聚,优势菌,厚壁菌门,Firmicutes,拟杆菌门,Bacteroidetes,放线菌,Actinobacteria,Ruminococcaceae,UCG,Christensenellaceae,group,Prevotellaceae,NK3B31,LEfSe,黔东南,黔北,瘤胃,Ruminococcus,乳杆菌属,Lactobacillus,普雷沃氏菌,PICRUSt,预测分析,碳水化合物代谢,氨基酸代谢途径,细菌菌群多样性,圈养,藏猪,核心菌群,猪肠,肠道菌群,疾病预防,基础资料,生理生化,保护管理,种群生态学,肠道微生物
AB值：
0.396454
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
