典型文献
乳腺浸润性导管癌中lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络的整合分析
文献摘要：
目的 构建乳腺浸润性导管癌的特异性ceRNA调控网络.方法 收集68例乳腺浸润性导管癌组织以及14例乳腺良性组织,以ANOVA P<0.05且|Fold Change(linear)|>2为基因差异表达筛选标准,采用人类全转录组基因表达谱HTA2.0芯片和miRNA4.0芯片来检测lncRNAs、mRNAs和miRNAs的表达;利用GDCRNATools包分析三者之间的ceRNA调控关系并用Cytoscape进行可视化;最后采用商业软件IPA分析差异表达的mRNAs参与的生物学功能.结果 与乳腺良性组织相比,乳腺浸润性导管癌组织中有513个mRNAs、293个lncRNAs和165个miRNAs存在差异表达;所构建的特异性ceRNA子网络,主要由4个lncR-NAs、3个miRNAs和61个mRNAs组成;异常表达的mRNAs在细胞学功能方面主要涉及到肿瘤细胞运动、细胞生长和增殖、细胞周期、侵袭和转移等.结论 构建了乳腺浸润性导管癌组织的特异性ceRNA网络,从而为进一步探讨网络中核心分子间的表达调控机制奠定基础.
文献关键词：
乳腺癌;浸润性导管癌;长链非编码RNA;miRNA;竞争性内源RNA
中图分类号：
作者姓名：
高建;金亦;林洁;林圣;段山
作者机构：
南方医科大学附属深圳妇幼保健院妇幼医学研究所实验室 广东深圳518040;中山大学附属第三医院病理科 广东广州510630;深圳市卫生健康发展研究和数据管理中心分子医学实验室 广东深圳518028
文献出处：
引用格式：
[1]高建;金亦;林洁;林圣;段山-.乳腺浸润性导管癌中lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络的整合分析)[J].广东医学,2022(07):804-810
A类：
HTA2,miRNA4,GDCRNATools
B类：
乳腺浸润性导管癌,ceRNA,整合分析,调控网络,癌组织,ANOVA,Fold,Change,linear,基因差异表达,筛选标准,转录组,基因表达谱,lncRNAs,mRNAs,miRNAs,包分析,Cytoscape,商业软件,IPA,生物学功能,子网络,异常表达,细胞学,肿瘤细胞,细胞运动,细胞生长,细胞周期,侵袭和转移,表达调控,调控机制,长链非编码,竞争性
AB值：
0.277732
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