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宏基因组高通量测序在难治性尿路感染诊治中的应用3例
文献摘要：
尿路感染是泌尿外科的常见疾病,然而许多患者表现为顽固性、难治性或慢性尿路感染症状,对生活与工作造成巨大影响.目前临床中的常用检测为尿常规、中段尿培养等,存在较高的假阴性发生率.宏基因组测序高通量测序(mNGS)以往多应用于肿瘤和遗传病诊断,在尿路感染方面尚未开展,本研究探索了 mNGS在顽固性尿路感染治疗中的应用价值.3例顽固性尿路感染女性患者,年龄分别为25、26和57岁,尿常规、尿三杯和中段尿培养无明显病原体证据,经过经验性用药无明显缓解.患者进行中段尿液样本采集和mNGS检测,通过基因序列分析细菌、真菌、病毒等基因,并提供耐药基因报告.随后进行敏感性药物应用,每周进行随访,收集患者主诉和尿常规、尿培养报告.治疗成功标准为患者主诉下尿路症状好转、尿常规和尿培养阴性.3例患者的mNGS检测均发现了多种微生物感染和耐药基因,使用敏感抗生素治疗后症状明显好转.以上病例提示,mNGS能够发现常规尿液检查无法获得的病原微生物数据和耐药基因数据,对指导临床药物选择、缩短患者感染病程、减少抗生素的经验性滥用有促进作用,可作为常规病原学检测无法解释的复杂性尿路感染,以及排除病因不明的下尿路症状患者的可选性检测方法.
文献关键词：
尿路感染;宏基因组;下尿路症状;病原微生物
中图分类号：
作者姓名：
齐尔;刘立;谢珍;张楷乐;傅强
作者机构：
上海市徐汇区斜土街道社区卫生服务中心 上海,200032;上海麦凯生物科技有限公司;南京实践医学检验有限公司;上海市第六人民医院泌尿外科
文献出处：
引用格式：
[1]齐尔;刘立;谢珍;张楷乐;傅强-.宏基因组高通量测序在难治性尿路感染诊治中的应用3例)[J].临床泌尿外科杂志,2022(11):869-871
A类：
B类：
宏基因组高通量测序,难治性,泌尿外科,常见疾病,顽固性,慢性尿路感染,感染症状,巨大影响,尿常规,中段尿培养,假阴性,宏基因组测序,mNGS,多应用,遗传病诊断,研究探索,女性患者,三杯,病原体,体证,经验性,中段尿液,尿液样本,样本采集,基因序列分析,耐药基因,性药物,药物应用,主诉,成功标准,下尿路症状,养阴,微生物感染,敏感抗生素,抗生素治疗,明显好转,常规尿液检查,查无,病原微生物,生物数据,基因数据,临床药物,药物选择,感染病,病原学检测,无法解释,复杂性尿路感染,除病,病因不明,可选性
AB值：
0.324419
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