典型文献
丹系大白母猪背膘厚性状的全基因组关联分析
文献摘要：
背膘厚影响生猪育肥效果、脂肪沉积能力及母猪繁殖性能,是大白猪选育的重要指标之一.为寻找与丹系大白母猪背膘厚性状相关的分子标记,利用55K SNP芯片对695头大白母猪群体进行基因分型,并对背膘厚性状进行全基因组关联分析(GWAS),筛选显著影响背膘厚性状的单核苷酸多态性(SNP)位点及候选基因.结果表明:丹系大白母猪平均背膘厚为9.33 mm,经质控后共获得64 812个SNP位点,GW AS分析筛选出2个与背膘厚显著相关的SNPs(rs332580652、rs336799903);群体遗传多样性分析显示,仅rs336799903多态性分布处于Hardy-Weinberg平衡,且该位点在丹系大白猪群体中呈中度多态;对关联显著的SNPs上下游200 kb内编码基因进行筛查,共发现4个候选基因(ENSSSCG00000021336、THEG,ENSSSCG00000020950、ENSSSCG00000026639);对关联显著的 SNPs 与染色质修饰关系进行注释,发现rs332580652仅仅在肝脏组织中存在H3K27me3修饰,而rs336799903在猪的不同组织中存在H3K27me3和ATAC修饰.综上,利用GW AS筛选出丹系大白母猪背膘厚相关SNPs及候选基因,为后续通过分子育种手段降低丹系大白母猪背膘厚进而改善猪肉品质,为生猪绿色健康养殖提供一定的理论依据和借鉴.
文献关键词：
大白猪;背膘厚;全基因组关联分析;SNP;候选基因
中图分类号：
作者姓名：
吴正常;单祎祎;黄小国;吴圣龙;包文斌
作者机构：
扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009;江苏康乐农牧有限公司,江苏丹阳212300
文献出处：
引用格式：
[1]吴正常;单祎祎;黄小国;吴圣龙;包文斌-.丹系大白母猪背膘厚性状的全基因组关联分析)[J].扬州大学学报（农业与生命科学版）,2022(06):60-66
A类：
丹系大白母猪,rs332580652,rs336799903,丹系大白猪,ENSSSCG00000021336,THEG,ENSSSCG00000020950,ENSSSCG00000026639
B类：
背膘厚,全基因组关联分析,生猪,育肥效果,脂肪沉积,猪繁殖,繁殖性能,选育,分子标记,55K,猪群,基因分型,GWAS,单核苷酸多态性,候选基因,质控,共获,SNPs,群体遗传,遗传多样性分析,Hardy,Weinberg,该位,对关联,上下游,kb,编码基因,染色质,肝脏组织,H3K27me3,不同组织,ATAC,分子育种,猪肉品质,绿色健康养殖
AB值：
0.199722
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
