典型文献
多组学数据解析循环及浸润性B细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用
文献摘要：
目的·探究循环及浸润性B细胞亚群在结直肠癌免疫微环境中的作用,探寻B细胞发育的潜在驱动机制,分析免疫微环境中B细胞与其他免疫细胞的互作关系及通信分子的功能,并寻找可能的调控途径以促进B细胞的抗肿瘤效应.方法·收集3例结直肠癌患者的癌旁(正常)、肿瘤和外周血共计9份样本,分别制备单细胞悬液.通过多色流式细胞仪分选免疫细胞后,利用10X Genomics平台进行单细胞转录组和B细胞受体组库(B cell receptor repertoire,BCR)测序,并使用Seurat等生信工具进行数据分析,从肿瘤与正常组织中B细胞的浸润数量及功能方面的差异、B细胞亚群与T细胞以及与髓系细胞亚群的互作关系、B细胞亚群的转录因子调控网络等角度进行探索分析.结果·与正常组织相比较,CD20+B细胞亚群在肿瘤组织中的浸润数量显著上升;其中,以生发中心B细胞(germinal center B cells,GCB)的作用最突出,发生积极的克隆扩增和重链突变水平的提升,并且向记忆B细胞分化的趋势增加.然而,浆细胞在肿瘤微环境中的数量大幅减少,以分泌IgA类抗体的浆细胞减少最为明显.此外,相较正常组织的免疫微环境,肿瘤组织中的GCB细胞与T细胞等其他免疫细胞的联系变得更加紧密,正向调控免疫功能的通信分子对显著富集.结论·GCB在结直肠癌肿瘤微环境中的作用大幅提升,以自身显著提升的重链突变水平来提高其对肿瘤抗原的亲和力,同时和微环境中的免疫细胞联系增强,发挥着积极的抗肿瘤效应.
文献关键词：
生物信息学;单细胞测序;结直肠癌;免疫学;B细胞
中图分类号：
作者姓名：
龚其雨;陈磊
作者机构：
上海交通大学医学院上海市免疫学研究所,上海 200025
文献出处：
引用格式：
[1]龚其雨;陈磊-.多组学数据解析循环及浸润性B细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用)[J].上海交通大学学报（医学版）,2022(04):472-481
A类：
B类：
多组学数据,数据解析,浸润性,免疫微环境,细胞亚群,细胞发育,驱动机制,免疫细胞,互作关系,调控途径,抗肿瘤效应,结直肠癌患者,癌旁,单细胞悬液,多色,流式细胞仪,分选,10X,Genomics,单细胞转录组,细胞受体,receptor,repertoire,BCR,Seurat,生信,正常组织,髓系细胞,调控网络,探索分析,CD20+B,肿瘤组织,生发中心,germinal,center,cells,GCB,细胞分化,浆细胞,肿瘤微环境,IgA,类抗体,较正,加紧,癌肿,肿瘤抗原,亲和力,单细胞测序,免疫学
AB值：
0.367537
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