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中华绒螯蟹微孢子虫全基因组分泌蛋白的预测分析
文献摘要：
本试验运行真核生物分泌蛋白预测流程EuSecPred 2.0在中华绒螯蟹微孢子虫全基因组范围内预测分泌蛋白,同时分析分泌蛋白的序列特征,注释功能.结果表明,分泌蛋白序列长度大多为30～300 aa;信号肽长度为11～23 aa;信号肽切割位点处主要由疏水性氨基酸组成;对预测所得蛋白质功能的注释,发现了多种关键蛋白,如血凝素酯酶、甲基转移酶EZH1和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等.基序分析发现,信号肽中存在基序S[NS]N[TI][FI]VI[IGD][RG]VRC.预测获得的这些重要分泌蛋白与中华绒螯蟹微孢子虫侵染宿主、调控宿主细胞周期及免疫反应等生理活动相关,可为筛选致病相关候选因子和探究其侵染机理提供重要依据.
文献关键词：
中华绒螯蟹微孢子虫;分泌蛋白;基因组;信号肽;基序
中图分类号：
作者姓名：
宁梓健;寇诗瑀;包杰;姜宏波
作者机构：
沈阳农业大学 畜牧兽医学院,辽宁 沈阳 110866
文献出处：
引用格式：
[1]宁梓健;寇诗瑀;包杰;姜宏波-.中华绒螯蟹微孢子虫全基因组分泌蛋白的预测分析)[J].水产科学,2022(02):280-288
A类：
中华绒螯蟹微孢子虫,EuSecPred,EZH1
B类：
全基因组,分泌蛋白,预测分析,真核生物,测流,序列特征,aa,信号肽,切割位点,疏水性,氨基酸组成,蛋白质功能,关键蛋白,血凝素,酯酶,甲基转移酶,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,基序,NS,TI,FI,VI,IGD,RG,VRC,侵染,宿主,主细胞,细胞周期,免疫反应
AB值：
0.326538
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