典型文献
不同氮形态处理条件下杨树根尖差异表达基因的特征分析
文献摘要：
[目的]利用高通量转录组测序技术,在硝态氮或铵态氮处理条件下,对杨树根尖差异表达基因进行了筛选和研究,同时分析和描述了差异表达基因对杨树根尖生长发育的影响,为后续开发高氮素吸收利用效率的杨树新种质提供科学依据.[方法]以灰杨幼苗根尖为材料,用0.5?mmol·L?1硝态氮(NO3?)和0.5 mmol·L?1铵态氮(NH4+)对幼苗处理10?d,并对植株根尖进行转录组测序以及生物信息学分析.[结果]硝态氮处理下的主根长度几乎是铵态氮处理条件下的一倍.从两种不同氮形态处理杨树根尖转录组文库中,筛选到2207个差异表达基因.通过差异基因GO和KEGG功能聚类分析,分别获得50个GO功能聚类和20条KEGG通路.进一步利用MapMan分析,筛选出36个氮代谢通路过程、各类氨基酸的生物合成以及代谢过程相关的差异表达基因.对这些差异基因互作调控网络分析发现,硝酸还原酶(Potri.005G172400)基因通过响应不同氮形态,在影响杨树根尖生长发育过程中发挥了重要作用.[结论]本研究获得了不同氮形态处理条件下杨树根尖差异表达基因,并对差异表达基因功能进行分析,有助于理解杨树通过响应不同氮形态影响根尖生长发育过程的分子机制.
文献关键词：
转录组;差异表达基因;杨树根尖;硝态氮;铵态氮
中图分类号：
作者姓名：
周婧;李卓蓉;吴江婷
作者机构：
林木遗传育种国家重点实验室,国家林业和草原局森林培育重点实验室,中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091
文献出处：
引用格式：
[1]周婧;李卓蓉;吴江婷-.不同氮形态处理条件下杨树根尖差异表达基因的特征分析)[J].林业科学研究,2022(02):45-55
A类：
杨树根尖,MapMan,Potri,005G172400
B类：
氮形态,处理条件,差异表达基因,高通量转录组测序技术,硝态氮,铵态氮,氮处理,氮素吸收利用,新种质,幼苗,NO3,NH4+,对植,植株,生物信息学分析,主根长,一倍,文库,差异基因,氮代谢,代谢通路,路过,生物合成,代谢过程,基因互作,调控网络分析,硝酸还原酶,过响应,响杨,基因功能
AB值：
0.192823
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