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基于虚拟筛选与分子动力学模拟的方法探究潜在的半乳糖凝集素1的抑制剂
文献摘要：
目的:探究半乳糖凝集素-1(Gal-1)是否存在与小分子结合的位点,从中筛选出与Gal-1靶点特异性结合的分子.方法:应用分子对接的方法,搜寻小分子抑制物与Gal-1结合的可能位点,并利用虚拟筛选从包含5963个化合物的数据库中针对潜在位点进行对接,然后对得分高的蛋白配体复合物进行分子动力学(MD)模拟及MMPBSA分析.结果:位于Gal-1表面的口袋,ZINC000885764928与预测的口袋之间形成了较强的相互作用;虚拟筛选打分与MD模拟的参数证实了结合的稳定性.结论:肝内胆管癌(ICC)标志蛋白Gal-1与ZINC000885764928,ZINC000095618662的结合具有保守性,ZINC000885764928和ZINC000095618662可以作为潜在Gal-1抑制剂的分子骨架.
文献关键词：
肝内胆管癌;半乳糖凝集素-1;分子对接;虚拟筛选;分子动力学模拟
中图分类号：
作者姓名：
禹华松;梁中;成语;向伊羚;余星;张玉静
作者机构：
湖南师范大学医学院,长沙 410013
文献出处：
引用格式：
[1]禹华松;梁中;成语;向伊羚;余星;张玉静-.基于虚拟筛选与分子动力学模拟的方法探究潜在的半乳糖凝集素1的抑制剂)[J].湖南师范大学学报（医学版）,2022(05):12-16
A类：
ZINC000885764928,ZINC000095618662
B类：
虚拟筛选,分子动力学模拟,方法探究,半乳糖凝集素,Gal,小分子,分子结,特异性结合,分子对接,搜寻,抑制物,个化,在位,复合物,MD,MMPBSA,口袋,打分,肝内胆管癌,ICC,保守性
AB值：
0.218938
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