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典型文献
基于网络拓扑和多种生物信息融合的关键蛋白质识别算法
文献摘要:
关键蛋白质的识别有助于了解细胞存活的基本需求,并为疾病治疗找到新方法,但是蛋白质自身携带着复杂的生物特性,仅依赖网络拓扑特性不能精准地判断其关键性.因此,提出一种新方法来提高识别关键蛋白质的准确率.首先,考虑网络拓扑特性以及蛋白质在不同亚细胞中的重要程度,定义了SNC方法;其次,利用蛋白质在亚细胞与复合物信息中的特性定义了SIDC方法;最后,通过融合网络拓扑结构和多源生物信息,提出了关键蛋白质识别算法CTB.在YDIP、YMIPS和Krogan数据集上利用精准率-查全率等多种评估方法进行实验,结果表明CTB算法提高了识别关键蛋白质的性能.
文献关键词:
蛋白质相互作用网络;关键蛋白质;亚细胞定位;蛋白质复合物
作者姓名:
卢鹏丽;陈云天
作者机构:
兰州理工大学计算机与通信学院,甘肃兰州 730050
引用格式:
[1]卢鹏丽;陈云天-.基于网络拓扑和多种生物信息融合的关键蛋白质识别算法)[J].兰州理工大学学报,2022(06):96-103
A类:
SIDC,YDIP,YMIPS,Krogan
B类:
拓扑和,信息融合,关键蛋白质,识别算法,细胞存活,基本需求,疾病治疗,生物特性,依赖网络,拓扑特性,别关,重要程度,SNC,融合网络,网络拓扑结构,CTB,查全率,蛋白质相互作用网络,亚细胞定位,蛋白质复合物
AB值:
0.253214
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