典型文献
基于加权基因共表达网络分析探讨黄芩抗肝细胞癌的相关分子机制
文献摘要：
目的 通过网络药理学与加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)相结合的方法,找到黄芩抗肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的潜在作用靶点及相关信号通路,探讨其可能的分子作用机制.方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选黄芩的活性成分及靶点,利用CytoHubba插件获取黄芩前15个候选基因.通过癌症基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)、基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载HCC相关数据,利用R语言与TCGA、GEO的差异基因取交集,对交集基因进行富集分析和hub基因筛选,并进一步对hub基因及黄芩抗HCC潜在基因靶点进行总生存期(Overall survival,OS)、无病生存期(Disease free survival,DFS)分析和人类蛋白组图谱数据库(Human Protein Atlas,HPA)筛选.结果 检索筛选出19种黄芩主要活性成分和50个靶点,候选基因为NCOA1、ESR1、ADRA1A等.得到交集基因115个,经比对黄芩抗HCC的潜在基因靶点为ADRA1A.GO分析显示交集基因富集在体液免疫、补体激活等生物学过程,KEGG分析显示富集在胆固醇代谢、视黄醇代谢等通路.OS、DFS分析显示,FCN3、ADRA1A、C7、COLEC10、CFP这5个基因高表达时更利于患者生存.免疫组化结果显示,与癌旁组织相比,HCC组织中FCN3、C7表达量降低.结论 黄芩抗HCC的分子机制可能与体液免疫、补体激活和细胞凋亡等过程有关,通过靶点ADRA1A干预HCC的发生与转移.FCN3、C7、COLEC10、CFP可作为HCC的核心基因,可能在HCC的治疗中起重要作用,本研究有助于阐明黄芩防治HCC的潜在分子机制.
文献关键词：
肝细胞癌;黄芩;网络药理学;WGCNA
中图分类号：
作者姓名：
徐玉平;谭荣;蒋向辉
作者机构：
凯里学院大健康学院 凯里 556011
文献出处：
引用格式：
[1]徐玉平;谭荣;蒋向辉-.基于加权基因共表达网络分析探讨黄芩抗肝细胞癌的相关分子机制)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(12):4659-4670
A类：
FCN3
B类：
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AB值：
0.380703
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